68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0192 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 631 aa  1289    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  52.49 
 
 		 609 aa  601  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.48 
 
 		 612 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.64 
 
 		 683 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.47 
 
 		 683 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.64 
 
 		 684 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  51.81 
 
 		 627 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.3 
 
 		 683 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.3 
 
 		 658 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.74 
 
 		 619 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.95 
 
 		 663 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.3 
 
 		 665 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.3 
 
 		 659 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  50.79 
 
 		 627 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.83 
 
 		 613 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  50.69 
 
 		 610 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  49.31 
 
 		 615 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.02 
 
 		 634 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  36.89 
 
 		 634 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  35.41 
 
 		 592 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.54 
 
 		 581 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.79 
 
 		 581 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.01 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.12 
 
 		 580 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  29.93 
 
 		 576 aa  263  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  29.51 
 
 		 570 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.95 
 
 		 577 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  29.56 
 
 		 575 aa  239  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.72 
 
 		 580 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.55 
 
 		 526 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  23.02 
 
 		 484 aa  127  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.14 
 
 		 618 aa  97.8  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.45 
 
 		 606 aa  95.1  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.27 
 
 		 606 aa  92.8  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.51 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.86 
 
 		 599 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.83 
 
 		 862 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  26.84 
 
 		 840 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  20.64 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.1 
 
 		 911 aa  57.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.73 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.95 
 
 		 834 aa  54.7  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  24.06 
 
 		 823 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  26.9 
 
 		 906 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.23 
 
 		 850 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  24.77 
 
 		 816 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.79 
 
 		 384 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.38 
 
 		 585 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  27.93 
 
 		 836 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.67 
 
 		 361 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  27.14 
 
 		 885 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.08 
 
 		 422 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  26.19 
 
 		 384 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.65 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.09 
 
 		 829 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.58 
 
 		 557 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.91 
 
 		 380 aa  47.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.91 
 
 		 380 aa  47.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.43 
 
 		 848 aa  47.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.34 
 
 		 848 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  27.44 
 
 		 375 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2208  zinc carboxypeptidase-related protein  31.01 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.878769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.41 
 
 		 1034 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  27.64 
 
 		 305 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.34 
 
 		 845 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.6 
 
 		 852 aa  43.9  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  30.4 
 
 		 306 aa  43.9  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.15 
 
 		 375 aa  43.9  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>