141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0187 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0187  ATPase  100 
 
 
339 aa  699    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000236407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0439  ATPase  61.42 
 
 
340 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000906876  unclonable  0.0000000000000120536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0093  hypothetical protein  61.13 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000000492521  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2633  ATPase  59.64 
 
 
340 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2258  ATPase domain protein  39.18 
 
 
360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4106  ATPase domain-containing protein  37.01 
 
 
355 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000114229  unclonable  0.0000000119877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3749  ATPase domain-containing protein  35.31 
 
 
340 aa  202  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000275778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0397  ATPase domain-containing protein  33.81 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  34.69 
 
 
359 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2581  ATPase domain protein  30.72 
 
 
339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000379448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  33.54 
 
 
360 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31363  predicted protein  25.52 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0616493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2377  chromosome partitioning ATPase  25.99 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.0000000329135  unclonable  0.0000000236411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.75 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.68 
 
 
472 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.17 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  27.23 
 
 
254 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.4 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.36 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.7 
 
 
258 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.24 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.82 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 
330 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  26.89 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
281 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.5 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.01 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.49 
 
 
254 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.74 
 
 
258 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  29.26 
 
 
460 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
259 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.44 
 
 
366 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 
255 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.12 
 
 
254 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
340 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3976  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0294413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.12 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.62 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3898  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 
254 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.94 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3835  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
316 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
263 aa  53.1  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.96 
 
 
256 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  23.38 
 
 
258 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.47 
 
 
254 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.39 
 
 
257 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  24.39 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.86 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0987  partition protein, ParA-like  25.25 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000325119  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  25.79 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.39 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.96 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3120  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136524  normal  0.126924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.89 
 
 
265 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.58 
 
 
257 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
408 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.54 
 
 
259 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  22.18 
 
 
259 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.75 
 
 
262 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
340 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.07 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.34 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.77 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.15 
 
 
443 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.41 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.06 
 
 
480 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.17 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
258 aa  47.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.47 
 
 
257 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  26.96 
 
 
255 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  25.33 
 
 
258 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 
294 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 
294 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  27.45 
 
 
255 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  23.04 
 
 
365 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.29 
 
 
487 aa  46.2  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
302 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  25.12 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.89 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  25.26 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  24.74 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.99 
 
 
257 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D24  ATPase for chromosome partitioning  22.54 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0126425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>