117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0171 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 96 aa  176  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  74.58 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  62.9 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  62.71 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  62.71 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  62.71 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  66.1 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  64.41 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  61.02 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  61.02 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  62.71 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0180  ATP synthase, subunit C (H(+)-transporting two-sector ATPase)  71.74 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.51432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  60.71 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  60.71 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  73.47 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  64.29 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  64.15 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  61.02 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  69.39 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3215  ATP synthase F0, C subunit  69.57 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.112485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1230  ATP synthase F0, C subunit  65 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  47.62 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1717  ATP synthase F0, C subunit  57.5 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000377801  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  42.62 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  36.11 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  36.11 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  36.11 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  36.11 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  39.34 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  35.21 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  48.28 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  34.85 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.83 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  32.79 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  44.9 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  42.31 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  40.98 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  57.78 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  39.66 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  43.86 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  40.62 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  33.7 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  40.62 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  40.62 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  41.38 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  43.86 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  43.75 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  43.86 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  32.26 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  35.82 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  45.61 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  42.31 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  49.06 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  50 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  38.98 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  39.22 
 
 		 75 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  43.86 
 
 		 82 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0295  F0F1 ATP synthase subunit C  31.58 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  43.86 
 
 		 82 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  38.98 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  43.86 
 
 		 82 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1300  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  36.78 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  37.93 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>