86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0100 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0100  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
1193 aa  2369    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 
853 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  36.72 
 
 
861 aa  58.9  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.74 
 
 
847 aa  58.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.18 
 
 
835 aa  56.2  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 
846 aa  56.2  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0430  hypothetical protein  30.95 
 
 
884 aa  54.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.74 
 
 
842 aa  52  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  31.82 
 
 
821 aa  51.6  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  29.92 
 
 
873 aa  50.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.51 
 
 
852 aa  51.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 
859 aa  51.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  27.09 
 
 
857 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  32.96 
 
 
845 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  26.97 
 
 
421 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  26.13 
 
 
404 aa  49.7  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
452 aa  50.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  36.62 
 
 
926 aa  49.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
930 aa  49.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.29 
 
 
836 aa  49.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  23.76 
 
 
408 aa  49.3  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  35.9 
 
 
379 aa  48.9  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.89 
 
 
397 aa  49.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
457 aa  48.9  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 
855 aa  48.9  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  34 
 
 
443 aa  48.9  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  30.33 
 
 
849 aa  48.5  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 
873 aa  48.5  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  30.94 
 
 
841 aa  48.5  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.89 
 
 
397 aa  48.5  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 
817 aa  48.5  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  38.89 
 
 
495 aa  47.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 
849 aa  48.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25 
 
 
841 aa  47.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  32.09 
 
 
465 aa  47.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  24.66 
 
 
405 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
435 aa  48.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
855 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 
463 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  24.84 
 
 
441 aa  47  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
419 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  26.56 
 
 
421 aa  47.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 
857 aa  47  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 
405 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 
796 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  39.73 
 
 
402 aa  47.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.94 
 
 
437 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  36 
 
 
406 aa  47  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  25.45 
 
 
876 aa  46.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  27.93 
 
 
868 aa  46.6  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  27.27 
 
 
404 aa  46.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  32.43 
 
 
843 aa  46.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 
1132 aa  46.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  36.36 
 
 
397 aa  46.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1851  ABC transporter, permease protein, putative  36.76 
 
 
506 aa  46.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00637092  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  34.57 
 
 
397 aa  46.2  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  36.84 
 
 
655 aa  46.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.03 
 
 
383 aa  46.2  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0909  hypothetical protein  25.56 
 
 
813 aa  46.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  26.67 
 
 
1132 aa  46.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
404 aa  45.8  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  33.61 
 
 
411 aa  45.8  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.21 
 
 
409 aa  45.8  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  29.37 
 
 
854 aa  45.8  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  33.33 
 
 
404 aa  45.8  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  34.31 
 
 
408 aa  45.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 
853 aa  45.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.68 
 
 
423 aa  45.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  40.58 
 
 
853 aa  45.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  27.05 
 
 
413 aa  45.4  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1059  cell division protein FtsX  27.78 
 
 
311 aa  45.4  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1027  hypothetical protein  27.01 
 
 
786 aa  45.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
419 aa  45.1  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  36.11 
 
 
871 aa  45.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  32.48 
 
 
416 aa  45.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 
408 aa  45.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0192  ABC transporter related  31.34 
 
 
597 aa  45.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000020543  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1028  hypothetical protein  31.58 
 
 
854 aa  45.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1718  hypothetical protein  40 
 
 
912 aa  45.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 
415 aa  45.1  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 
452 aa  45.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  37.14 
 
 
427 aa  45.1  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  25.44 
 
 
1090 aa  45.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  25.73 
 
 
421 aa  45.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  34.78 
 
 
386 aa  44.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  36.51 
 
 
414 aa  44.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>