23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0090 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  100 
 
 		 731 aa  1497    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  34.3 
 
 		 685 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  21.63 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 499 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 514 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 491 aa  55.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 486 aa  55.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 495 aa  54.7  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 662 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  28.32 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 506 aa  53.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 		 528 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 		 590 aa  49.7  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 559 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 500 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 443 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 448 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>