More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0082 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0082  type II secretion system protein E  100 
 
 		 600 aa  1226    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  46.58 
 
 		 871 aa  356  7.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  46.84 
 
 		 563 aa  352  8e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  46.32 
 
 		 556 aa  349  8e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  46.09 
 
 		 561 aa  347  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  42.67 
 
 		 558 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  43.42 
 
 		 558 aa  343  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  45.05 
 
 		 558 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  44.21 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  43.85 
 
 		 482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  40.18 
 
 		 610 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  42.93 
 
 		 577 aa  337  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  45 
 
 		 557 aa  336  7e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.83 
 
 		 570 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  45.71 
 
 		 561 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  45.26 
 
 		 557 aa  334  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  40.97 
 
 		 580 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  45.04 
 
 		 570 aa  333  7.000000000000001e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  43.01 
 
 		 787 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  43.47 
 
 		 552 aa  332  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  42.59 
 
 		 570 aa  332  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  44.71 
 
 		 523 aa  331  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  44.44 
 
 		 523 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  45.24 
 
 		 518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.12 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  44.41 
 
 		 583 aa  327  3e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  44.18 
 
 		 514 aa  327  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  42.2 
 
 		 555 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  44.53 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 		 520 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  44.44 
 
 		 521 aa  326  7e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  45.5 
 
 		 598 aa  326  7e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  44.18 
 
 		 521 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  44.33 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  43.62 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  44.18 
 
 		 521 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  41.94 
 
 		 573 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  43.57 
 
 		 572 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.86 
 
 		 599 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  43.65 
 
 		 520 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  44.44 
 
 		 521 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  43.92 
 
 		 524 aa  324  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  44.44 
 
 		 521 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  44.44 
 
 		 521 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  43.92 
 
 		 521 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 		 507 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  44.44 
 
 		 521 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  43.65 
 
 		 520 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  42.59 
 
 		 514 aa  323  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.86 
 
 		 553 aa  323  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.86 
 
 		 599 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  45.24 
 
 		 498 aa  323  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  43.09 
 
 		 497 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  44.97 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  43.04 
 
 		 546 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  43.85 
 
 		 583 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  44.97 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  43.77 
 
 		 583 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  43.95 
 
 		 575 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  42.82 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  42.82 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  43.09 
 
 		 497 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  44.62 
 
 		 578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  44.18 
 
 		 514 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  43.92 
 
 		 523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.34 
 
 		 599 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  43.73 
 
 		 500 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  44.18 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 		 521 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  43.39 
 
 		 468 aa  320  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  44.53 
 
 		 577 aa  320  7e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  44.77 
 
 		 568 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  40.79 
 
 		 560 aa  319  9e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  42.56 
 
 		 417 aa  319  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  42.56 
 
 		 585 aa  318  1e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  43.47 
 
 		 503 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.1 
 
 		 603 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  43.63 
 
 		 469 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  43.38 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  42.93 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  44.18 
 
 		 521 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  44.18 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  42.13 
 
 		 585 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  43.36 
 
 		 469 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.39 
 
 		 553 aa  316  7e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.68 
 
 		 571 aa  316  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.26 
 
 		 571 aa  316  8e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  40.29 
 
 		 563 aa  316  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  45 
 
 		 501 aa  316  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1387  type II secretion system protein E  41.49 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00517077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  39.63 
 
 		 567 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  44.44 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  41.91 
 
 		 561 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  40.57 
 
 		 595 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  43.65 
 
 		 494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.63 
 
 		 568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  42.29 
 
 		 591 aa  315  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  38.84 
 
 		 576 aa  315  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  42.97 
 
 		 569 aa  315  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  43.24 
 
 		 611 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>