More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0079 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  100 
 
 		 389 aa  799    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  56.3 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  55.81 
 
 		 359 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  55.81 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  55.3 
 
 		 359 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  52.21 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.59 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  48.2 
 
 		 364 aa  358  9e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.61 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.7 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  46.75 
 
 		 361 aa  335  9e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  46.84 
 
 		 336 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  46.43 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.8 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  43.04 
 
 		 340 aa  308  8e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.82 
 
 		 334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.3 
 
 		 348 aa  301  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  42.71 
 
 		 335 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  42.45 
 
 		 335 aa  293  5e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1453  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  54.58 
 
 		 246 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.33 
 
 		 331 aa  289  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  42.45 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.33 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  41.99 
 
 		 336 aa  279  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  41.27 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  41.27 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  40.26 
 
 		 335 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  40.26 
 
 		 335 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  40.26 
 
 		 335 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  40.26 
 
 		 335 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  41.27 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  39.32 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  39.22 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  41 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  41.44 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.84 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  41 
 
 		 335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  38.7 
 
 		 336 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  43.49 
 
 		 334 aa  272  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  40.61 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  40.15 
 
 		 422 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  40.33 
 
 		 335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.09 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.93 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  39.2 
 
 		 418 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  39.41 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  39.41 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  39.61 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  39.61 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  40.15 
 
 		 418 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  40.15 
 
 		 418 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  40 
 
 		 428 aa  262  8.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  39.85 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1908  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.45 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  40.44 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  38.89 
 
 		 418 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.17 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  38.89 
 
 		 418 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  38.52 
 
 		 424 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  39.75 
 
 		 427 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  39.36 
 
 		 423 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2464  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  39.23 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  37.53 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.54 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1261  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  39.75 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.86 
 
 		 426 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1985  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  37.88 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  37.91 
 
 		 422 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.32 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  38.83 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1739  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  40.05 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  38.83 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  38.83 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0586  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.48 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0424  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.48 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3119  isocitrate dehydrogenase (NADP)  38.73 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0579  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.3 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0101  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  38.76 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.08 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  38.88 
 
 		 432 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  39.54 
 
 		 586 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  38.99 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  38.46 
 
 		 419 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3415  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.64 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  38.75 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.52 
 
 		 416 aa  250  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0310087  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.29 
 
 		 425 aa  249  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3616  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.48 
 
 		 418 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.133268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.13 
 
 		 418 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.4 
 
 		 589 aa  249  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0698  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.65 
 
 		 437 aa  249  8e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4011  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.13 
 
 		 418 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.120573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  39.01 
 
 		 487 aa  248  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  39.39 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  38.99 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  38.99 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  38.99 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  38.99 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1672  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.46 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.789911  normal  0.0375366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>