126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0076 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0076  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 749 aa  1537    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  26.39 
 
 		 351 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  23.98 
 
 		 594 aa  109  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  25.45 
 
 		 352 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  26.28 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  28.1 
 
 		 325 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  26.54 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.55 
 
 		 354 aa  103  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  24.92 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  25.44 
 
 		 352 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  26.99 
 
 		 350 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  25.15 
 
 		 352 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  26.69 
 
 		 350 aa  99.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  25.08 
 
 		 352 aa  99  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.19 
 
 		 352 aa  98.2  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  23.48 
 
 		 348 aa  97.8  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  25.77 
 
 		 351 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  25.23 
 
 		 350 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  27.33 
 
 		 350 aa  94.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  24.76 
 
 		 374 aa  90.9  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  23.01 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  23.67 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  27.36 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  20.99 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  26.42 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  24.39 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  22.68 
 
 		 355 aa  80.5  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  24.14 
 
 		 379 aa  80.1  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  25.48 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  25.44 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  21.67 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  26 
 
 		 355 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  23.19 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.64 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  23.69 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.33 
 
 		 354 aa  73.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.33 
 
 		 354 aa  73.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  21.75 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  21.75 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  23.14 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  23.18 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  23.18 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.14 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  22.47 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2849  fimbrial assembly family protein  23.95 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996397  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.47 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  22.39 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  20.48 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  21.67 
 
 		 345 aa  70.1  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  24.38 
 
 		 334 aa  70.5  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  22.56 
 
 		 351 aa  69.7  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  22.16 
 
 		 371 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  21.09 
 
 		 354 aa  69.7  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  22.95 
 
 		 359 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  22.47 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  21.98 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  22.4 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  21.25 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  22.79 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  25.1 
 
 		 361 aa  67.4  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  22.25 
 
 		 372 aa  67  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  22.68 
 
 		 359 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  22.68 
 
 		 359 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  23.15 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.12 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  24.61 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  23.1 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  24.61 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  22.84 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  22.89 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  21.54 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  23.23 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  22.29 
 
 		 355 aa  63.9  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  23.25 
 
 		 354 aa  63.9  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  22.32 
 
 		 355 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  20.29 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  22.59 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  21.69 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0722  fimbrial assembly family protein  23.15 
 
 		 528 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.48701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  21.58 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  20.55 
 
 		 356 aa  60.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  21.7 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  22.69 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  20.35 
 
 		 365 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  21.71 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.81 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  21.7 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0713  Fimbrial assembly family protein  25.1 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  22.81 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  24.79 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  22.38 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  20.78 
 
 		 348 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  20.96 
 
 		 359 aa  56.6  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  21.93 
 
 		 352 aa  56.6  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  24.09 
 
 		 351 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  23.39 
 
 		 356 aa  55.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.47 
 
 		 319 aa  55.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  25.71 
 
 		 282 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  26.47 
 
 		 293 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0953  type IV pilus assembly protein PilM  22.08 
 
 		 345 aa  55.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>