239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0069 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  100 
 
 
572 aa  1134    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  46.35 
 
 
596 aa  364  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  39.69 
 
 
490 aa  331  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  40.26 
 
 
531 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  40.55 
 
 
509 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  37.26 
 
 
502 aa  317  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  38.84 
 
 
522 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  36.6 
 
 
552 aa  311  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  37.39 
 
 
660 aa  306  8.000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  39.5 
 
 
557 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  38.19 
 
 
506 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  38.73 
 
 
513 aa  299  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  39.51 
 
 
486 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  38.11 
 
 
607 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  38.04 
 
 
516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  40.98 
 
 
491 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  35.12 
 
 
520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  35.12 
 
 
520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  40.96 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  37.29 
 
 
487 aa  279  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  35.5 
 
 
483 aa  279  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  41.49 
 
 
502 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  40.27 
 
 
481 aa  277  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  37.58 
 
 
458 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  38.59 
 
 
517 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  37.87 
 
 
566 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  37.83 
 
 
467 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  37.07 
 
 
540 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  35.14 
 
 
478 aa  256  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  35.06 
 
 
483 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  39.84 
 
 
485 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  37.72 
 
 
495 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  34.43 
 
 
466 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  35.66 
 
 
468 aa  234  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  36.38 
 
 
486 aa  225  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  35.48 
 
 
493 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  35.33 
 
 
499 aa  209  9e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  32.38 
 
 
536 aa  203  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  31.72 
 
 
522 aa  200  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  33.78 
 
 
509 aa  197  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  29.86 
 
 
531 aa  183  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  30.68 
 
 
543 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  31.2 
 
 
456 aa  177  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  28.81 
 
 
467 aa  176  9e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  31.42 
 
 
534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  31.42 
 
 
534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  31.42 
 
 
534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  29.77 
 
 
455 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  29.9 
 
 
473 aa  169  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  26.64 
 
 
456 aa  168  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  29.3 
 
 
474 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  29.68 
 
 
463 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  27.59 
 
 
487 aa  167  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  30.25 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  31.83 
 
 
456 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  28.99 
 
 
465 aa  164  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  27.92 
 
 
450 aa  163  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  29.4 
 
 
462 aa  163  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  29.81 
 
 
457 aa  159  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  29.31 
 
 
482 aa  159  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  29.25 
 
 
456 aa  158  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  29.32 
 
 
453 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  29.92 
 
 
464 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  28.07 
 
 
466 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  28.07 
 
 
466 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  28.46 
 
 
466 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  28.46 
 
 
466 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  27.57 
 
 
466 aa  149  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  27.48 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  27.48 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  27.94 
 
 
454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  31.22 
 
 
460 aa  147  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  30.29 
 
 
462 aa  145  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  27.59 
 
 
472 aa  136  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  27.59 
 
 
474 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  26.6 
 
 
487 aa  135  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  30.86 
 
 
476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  28.22 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  28.1 
 
 
570 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  25.57 
 
 
475 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  27.09 
 
 
471 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  23.53 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  28.03 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  25.39 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  25.73 
 
 
471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  24.32 
 
 
482 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  26.8 
 
 
498 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  26.57 
 
 
483 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  27.64 
 
 
478 aa  114  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  25.59 
 
 
491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  22.64 
 
 
491 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  27.83 
 
 
511 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  24.42 
 
 
482 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  29.63 
 
 
447 aa  104  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  22.26 
 
 
517 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  22.26 
 
 
517 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  25.61 
 
 
482 aa  101  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  23.64 
 
 
470 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  37.96 
 
 
466 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  24.06 
 
 
510 aa  100  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>