More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0067 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 714 aa  1454    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.61 
 
 		 687 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 647 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  50.7 
 
 		 702 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 706 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.39 
 
 		 705 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.36 
 
 		 630 aa  580  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.13 
 
 		 714 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.13 
 
 		 696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.96 
 
 		 663 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.96 
 
 		 663 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  50.65 
 
 		 635 aa  571  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.96 
 
 		 635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 610 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.68 
 
 		 607 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.75 
 
 		 618 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  48.58 
 
 		 646 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.75 
 
 		 618 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.49 
 
 		 653 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.34 
 
 		 607 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.2 
 
 		 614 aa  553  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  48.9 
 
 		 621 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  46.78 
 
 		 637 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 605 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.85 
 
 		 640 aa  554  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.01 
 
 		 625 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.54 
 
 		 602 aa  552  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  49.35 
 
 		 614 aa  549  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.24 
 
 		 639 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.66 
 
 		 639 aa  551  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  50.08 
 
 		 627 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  47.69 
 
 		 616 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.38 
 
 		 634 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.95 
 
 		 637 aa  549  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.42 
 
 		 658 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.9 
 
 		 599 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.33 
 
 		 615 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.15 
 
 		 645 aa  545  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 645 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  51.36 
 
 		 682 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 		 634 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.62 
 
 		 608 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.75 
 
 		 673 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.35 
 
 		 633 aa  548  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.22 
 
 		 634 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  49.51 
 
 		 605 aa  548  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.58 
 
 		 646 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.82 
 
 		 646 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.75 
 
 		 673 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.71 
 
 		 634 aa  548  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.76 
 
 		 759 aa  548  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.37 
 
 		 673 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  52.37 
 
 		 654 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 		 610 aa  548  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.81 
 
 		 632 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  47.3 
 
 		 633 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  47.3 
 
 		 633 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  47.3 
 
 		 633 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 		 633 aa  542  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.2 
 
 		 623 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.04 
 
 		 667 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  47.1 
 
 		 692 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 		 676 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.71 
 
 		 640 aa  545  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  48.41 
 
 		 627 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  47.3 
 
 		 633 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  46.44 
 
 		 623 aa  545  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.18 
 
 		 643 aa  545  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  52.96 
 
 		 753 aa  545  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  47.3 
 
 		 633 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  47.3 
 
 		 633 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.62 
 
 		 753 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  53.8 
 
 		 627 aa  544  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.61 
 
 		 640 aa  542  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.64 
 
 		 637 aa  545  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  47.46 
 
 		 633 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.1 
 
 		 655 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.29 
 
 		 624 aa  545  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.31 
 
 		 621 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 		 623 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.2 
 
 		 611 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  47.14 
 
 		 633 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  48.56 
 
 		 639 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  48.56 
 
 		 639 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.8 
 
 		 617 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  53.56 
 
 		 656 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.2 
 
 		 660 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.77 
 
 		 697 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.11 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.61 
 
 		 640 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  53.68 
 
 		 659 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.29 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  47.3 
 
 		 633 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  48.22 
 
 		 642 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.67 
 
 		 645 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.61 
 
 		 655 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  47.54 
 
 		 630 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  46.11 
 
 		 638 aa  535  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.9 
 
 		 635 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>