More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0066 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  100 
 
 		 882 aa  1783    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.51 
 
 		 743 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30.41 
 
 		 743 aa  230  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  29.43 
 
 		 743 aa  230  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.89 
 
 		 743 aa  229  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  29.94 
 
 		 743 aa  228  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  29.94 
 
 		 743 aa  228  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  29.78 
 
 		 743 aa  227  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  29.6 
 
 		 743 aa  225  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.1 
 
 		 743 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29.78 
 
 		 743 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  31.72 
 
 		 713 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  28.3 
 
 		 712 aa  208  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  31.05 
 
 		 701 aa  205  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  27.59 
 
 		 981 aa  196  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  29.66 
 
 		 706 aa  193  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  28 
 
 		 699 aa  193  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  28.82 
 
 		 730 aa  190  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  27.96 
 
 		 740 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  26.24 
 
 		 713 aa  188  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  30.79 
 
 		 714 aa  187  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  29.74 
 
 		 702 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  31.71 
 
 		 682 aa  181  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  30.12 
 
 		 974 aa  181  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  29.62 
 
 		 702 aa  181  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  28.28 
 
 		 778 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  31.08 
 
 		 733 aa  180  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  28.13 
 
 		 674 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  28.13 
 
 		 674 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  30.18 
 
 		 775 aa  177  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  28.3 
 
 		 753 aa  176  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  27.98 
 
 		 674 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  26.92 
 
 		 723 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  27.6 
 
 		 737 aa  169  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.91 
 
 		 812 aa  168  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  31.16 
 
 		 714 aa  165  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  29.79 
 
 		 974 aa  165  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  26.65 
 
 		 719 aa  161  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  27.87 
 
 		 780 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  26.31 
 
 		 836 aa  156  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  25.33 
 
 		 726 aa  156  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  26.83 
 
 		 747 aa  157  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.23 
 
 		 697 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  30.2 
 
 		 764 aa  150  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  28.53 
 
 		 708 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  29.25 
 
 		 750 aa  149  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  33.72 
 
 		 1146 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  42.2 
 
 		 709 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  33.72 
 
 		 1077 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  25 
 
 		 741 aa  135  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  24.56 
 
 		 746 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  23.47 
 
 		 758 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  38.1 
 
 		 1003 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  24.64 
 
 		 796 aa  129  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  25.44 
 
 		 729 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  35.77 
 
 		 1022 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  35.77 
 
 		 1022 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  24.34 
 
 		 735 aa  125  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  27.1 
 
 		 723 aa  124  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  24.47 
 
 		 978 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  25.11 
 
 		 783 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  32.47 
 
 		 998 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  33.6 
 
 		 1001 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  32.47 
 
 		 998 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  24.47 
 
 		 979 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  32.47 
 
 		 998 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  25.42 
 
 		 1049 aa  122  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  24.47 
 
 		 983 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  24.47 
 
 		 983 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.14 
 
 		 736 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  28.3 
 
 		 1013 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  35.83 
 
 		 1040 aa  121  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  33.33 
 
 		 1062 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  26.09 
 
 		 920 aa  120  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  33.33 
 
 		 1062 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  36.68 
 
 		 1028 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  36.68 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  24.92 
 
 		 717 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  25.04 
 
 		 745 aa  119  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  24.44 
 
 		 728 aa  119  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  32.27 
 
 		 1002 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  35.14 
 
 		 699 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  23.61 
 
 		 968 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  24.58 
 
 		 1155 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  50 
 
 		 778 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  28.19 
 
 		 1109 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  42.47 
 
 		 673 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  28.46 
 
 		 1054 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  27.8 
 
 		 1109 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  31.98 
 
 		 1000 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  27.54 
 
 		 968 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  30.28 
 
 		 745 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  24.2 
 
 		 734 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  25.8 
 
 		 737 aa  115  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  23.29 
 
 		 740 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  23.37 
 
 		 735 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  33.33 
 
 		 1089 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  28.57 
 
 		 1040 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  38.46 
 
 		 576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  23.41 
 
 		 766 aa  112  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>