More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0065 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0065  peptidase M24  100 
 
 
396 aa  809    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  41.88 
 
 
357 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  39.89 
 
 
354 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  41.83 
 
 
353 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  40.91 
 
 
353 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  39.09 
 
 
356 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  40.96 
 
 
361 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  40.96 
 
 
361 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  40.96 
 
 
361 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  40.96 
 
 
361 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  40.68 
 
 
361 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  40.68 
 
 
361 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  40.68 
 
 
361 aa  255  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  37.57 
 
 
357 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  38.97 
 
 
347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  40.4 
 
 
361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  42.27 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  39.14 
 
 
357 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  39.14 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  40.67 
 
 
359 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  39.55 
 
 
361 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  40.83 
 
 
347 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  42.61 
 
 
348 aa  247  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  38.64 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  38.4 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  38.71 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  38.68 
 
 
353 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  38.4 
 
 
353 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  38.68 
 
 
353 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  38.4 
 
 
353 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  38.4 
 
 
353 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  38.4 
 
 
353 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  38.75 
 
 
353 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  39.83 
 
 
362 aa  241  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  38.11 
 
 
353 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  39.43 
 
 
363 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  42.17 
 
 
357 aa  238  9e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  35.51 
 
 
353 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  35.51 
 
 
353 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  35.53 
 
 
353 aa  236  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  41.64 
 
 
355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  37.13 
 
 
357 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  42.03 
 
 
364 aa  232  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  36.95 
 
 
353 aa  232  9e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  41.93 
 
 
355 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  38.57 
 
 
362 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  37.43 
 
 
361 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  38.14 
 
 
356 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  35.69 
 
 
353 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  35.65 
 
 
359 aa  230  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  35.83 
 
 
359 aa  229  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  36.08 
 
 
355 aa  229  7e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  35.53 
 
 
356 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  36.18 
 
 
359 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  34.87 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  36.44 
 
 
352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  36.18 
 
 
356 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  37.6 
 
 
364 aa  226  8e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  35.46 
 
 
353 aa  225  8e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  35.9 
 
 
356 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  35.9 
 
 
356 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  38.64 
 
 
356 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  38.53 
 
 
359 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  35.9 
 
 
356 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  35.9 
 
 
356 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  37.01 
 
 
356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  35.8 
 
 
354 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  35.04 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  35.82 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  39.12 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  35.48 
 
 
356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  35.04 
 
 
356 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  38.78 
 
 
362 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  36.96 
 
 
354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  38.57 
 
 
381 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  34.62 
 
 
364 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  40.12 
 
 
357 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  35.38 
 
 
371 aa  210  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  39.29 
 
 
360 aa  209  6e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  33.88 
 
 
365 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  33.61 
 
 
365 aa  209  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  33.88 
 
 
365 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  33.88 
 
 
365 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  33.88 
 
 
365 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  36.68 
 
 
393 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  34.8 
 
 
357 aa  207  2e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  39.77 
 
 
363 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  36.1 
 
 
362 aa  207  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  36.72 
 
 
353 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  33.88 
 
 
365 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  36.94 
 
 
369 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  33.61 
 
 
365 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0604  peptidase M24  35.47 
 
 
354 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.10841  decreased coverage  0.00345461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  33.61 
 
 
365 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  36.75 
 
 
354 aa  206  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  33.61 
 
 
365 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  33.61 
 
 
365 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  38.48 
 
 
359 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  35.11 
 
 
353 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  36.92 
 
 
361 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>