More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0052 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0052  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.704857  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.99 
 
 
197 aa  237  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  57.36 
 
 
191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  58.55 
 
 
189 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  56.77 
 
 
190 aa  231  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  59.9 
 
 
188 aa  231  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04000  anthranilate synthase component II  58.95 
 
 
189 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5115  anthranilate synthase component II  58.67 
 
 
197 aa  230  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  56.63 
 
 
201 aa  230  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  57.51 
 
 
190 aa  230  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2749  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.92 
 
 
197 aa  230  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.466062  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  58.64 
 
 
195 aa  230  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  57.73 
 
 
195 aa  230  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4783  anthranilate synthase component II  58.67 
 
 
197 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.07 
 
 
188 aa  229  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  55.96 
 
 
192 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  57.29 
 
 
195 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2273  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.65 
 
 
196 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2324  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.65 
 
 
196 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  57.65 
 
 
197 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  55.96 
 
 
189 aa  228  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  56.48 
 
 
189 aa  228  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  56.12 
 
 
201 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3946  anthranilate synthase component II  56 
 
 
198 aa  228  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  57.29 
 
 
195 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  57.29 
 
 
195 aa  227  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  56.77 
 
 
195 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  56.77 
 
 
195 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  56.77 
 
 
195 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  56.77 
 
 
195 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  56.77 
 
 
195 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0974  anthranilate synthase component II  53.89 
 
 
207 aa  226  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000708757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  56.25 
 
 
195 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.02 
 
 
188 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  55.21 
 
 
195 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2128  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.5 
 
 
197 aa  225  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2801  anthranilate synthase component II  55.96 
 
 
202 aa  225  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0592  anthranilate synthase, component II  56.63 
 
 
199 aa  224  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747776  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0180  anthranilate synthase component II  56.48 
 
 
194 aa  224  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.223965  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0526  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.73 
 
 
202 aa  224  7e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  56.25 
 
 
195 aa  224  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0158  anthranilate synthase component II  55.96 
 
 
194 aa  224  7e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.965467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.48 
 
 
197 aa  224  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0420  anthranilate synthase component II  56.63 
 
 
197 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0538249  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  56.77 
 
 
192 aa  223  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0453  anthranilate synthase component II  56.63 
 
 
197 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1441  anthranilate synthase component II  52.33 
 
 
207 aa  223  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.100747  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4125  anthranilate synthase, component II  56.48 
 
 
191 aa  223  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3720  anthranilate synthase component II  55.44 
 
 
195 aa  223  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0806  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  54.36 
 
 
197 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000445998  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0367  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.6 
 
 
192 aa  222  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  57.29 
 
 
189 aa  221  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46130  anthranilate synthase component II  54.08 
 
 
197 aa  221  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  56.77 
 
 
189 aa  221  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0907  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.4 
 
 
201 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000149415  hitchhiker  0.00000000332325 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0752  anthranilate synthase, component II  53.37 
 
 
192 aa  220  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3855  para-aminobenzoate synthase component II  53.89 
 
 
191 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2446  anthranilate synthase, component II  57.14 
 
 
197 aa  219  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  55.67 
 
 
188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27421  para-aminobenzoate synthase component II  54.55 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  54.4 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.92 
 
 
191 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  54.59 
 
 
199 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2711  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.31 
 
 
196 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  53.37 
 
 
238 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2938  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.96 
 
 
191 aa  218  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  54.17 
 
 
187 aa  217  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  54.17 
 
 
187 aa  217  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  54.17 
 
 
187 aa  217  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.17 
 
 
192 aa  217  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  53.65 
 
 
192 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  54.17 
 
 
187 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2780  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  55.84 
 
 
199 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2495  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.4 
 
 
193 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0786321  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  54.4 
 
 
197 aa  216  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.73 
 
 
190 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  55.73 
 
 
190 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3171  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.82 
 
 
197 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511386  normal  0.171933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  53.61 
 
 
191 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  53.65 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  53.89 
 
 
187 aa  215  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4993  anthranilate synthase glutamine amidotransferase  54.82 
 
 
199 aa  214  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.06 
 
 
193 aa  214  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0176  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.92 
 
 
188 aa  214  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0400  anthranilate synthase, component II  57.14 
 
 
200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  51.79 
 
 
200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0575  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.6 
 
 
195 aa  214  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267305  normal  0.552155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  53.65 
 
 
190 aa  214  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  53.65 
 
 
190 aa  214  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2585  anthranilate synthase component II  54.45 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0613  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  54.17 
 
 
191 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1475  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.33 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00621509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0641  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.79 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3948  para-aminobenzoate synthase component II  51.56 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0244  para-aminobenzoate synthase component II  51.56 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0673282  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2729  para-aminobenzoate synthase component II  52.85 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3423  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  54.36 
 
 
196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585956  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3705  para-aminobenzoate synthase component II  51.56 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0607  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  52.76 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00205694  normal  0.186857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0606  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  53.65 
 
 
191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>