161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0048 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  100 
 
 		 788 aa  1593    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  25.76 
 
 		 807 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.51 
 
 		 835 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  25.2 
 
 		 755 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.54 
 
 		 808 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.14 
 
 		 800 aa  165  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  25.06 
 
 		 825 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.25 
 
 		 807 aa  161  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.99 
 
 		 821 aa  156  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.86 
 
 		 806 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.64 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  22.52 
 
 		 828 aa  142  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.26 
 
 		 813 aa  140  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  22.95 
 
 		 823 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  22.24 
 
 		 859 aa  138  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  22.82 
 
 		 823 aa  138  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  22.82 
 
 		 823 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  23.33 
 
 		 824 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.95 
 
 		 816 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.33 
 
 		 821 aa  129  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.33 
 
 		 815 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.86 
 
 		 773 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  24.85 
 
 		 756 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.97 
 
 		 831 aa  114  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  24.75 
 
 		 751 aa  112  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.5 
 
 		 778 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.36 
 
 		 800 aa  108  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.08 
 
 		 762 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  17.77 
 
 		 767 aa  102  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.68 
 
 		 837 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  23.96 
 
 		 779 aa  99  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  27.41 
 
 		 872 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.49 
 
 		 803 aa  92  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.36 
 
 		 788 aa  87.4  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1083 aa  87.4  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  24.77 
 
 		 764 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  21.85 
 
 		 1204 aa  84.3  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.65 
 
 		 801 aa  83.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.01 
 
 		 815 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.42 
 
 		 727 aa  83.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  23.85 
 
 		 811 aa  82.4  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  23.59 
 
 		 763 aa  81.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  27.8 
 
 		 905 aa  81.3  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  22.95 
 
 		 765 aa  80.9  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  21.2 
 
 		 1359 aa  80.1  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.47 
 
 		 812 aa  79  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  20.48 
 
 		 820 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.62 
 
 		 804 aa  77.8  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  22.34 
 
 		 792 aa  77.4  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  23.04 
 
 		 864 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  20.14 
 
 		 789 aa  74.3  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  23.35 
 
 		 687 aa  71.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  26.79 
 
 		 865 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  23.87 
 
 		 889 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  29.6 
 
 		 967 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  21.06 
 
 		 789 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  24.46 
 
 		 694 aa  68.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  29.25 
 
 		 895 aa  68.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.08 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  20.73 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  19.32 
 
 		 778 aa  67  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.06 
 
 		 694 aa  67  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.32 
 
 		 869 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  20.52 
 
 		 797 aa  65.5  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  21.34 
 
 		 787 aa  65.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.87 
 
 		 1051 aa  64.7  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  19.6 
 
 		 748 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  21.05 
 
 		 692 aa  64.3  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.37 
 
 		 898 aa  63.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.62 
 
 		 746 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  20.59 
 
 		 881 aa  63.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  21.76 
 
 		 669 aa  63.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.06 
 
 		 752 aa  62.4  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  25.4 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  30.1 
 
 		 1131 aa  62.4  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  20.19 
 
 		 869 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  20.5 
 
 		 797 aa  60.8  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  21.85 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  22.63 
 
 		 752 aa  60.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  20.42 
 
 		 789 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  23.51 
 
 		 697 aa  59.7  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  29.35 
 
 		 874 aa  59.7  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  20.58 
 
 		 674 aa  59.3  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  21.95 
 
 		 821 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  24.52 
 
 		 860 aa  58.5  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.34 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.74 
 
 		 717 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  22.2 
 
 		 769 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.36 
 
 		 756 aa  57.4  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  22.05 
 
 		 877 aa  57.4  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  19.41 
 
 		 785 aa  57.4  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  31.09 
 
 		 1011 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  26.09 
 
 		 879 aa  56.6  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  28.57 
 
 		 862 aa  56.6  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  28.83 
 
 		 758 aa  55.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  21.15 
 
 		 799 aa  55.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  20.26 
 
 		 772 aa  55.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  19.04 
 
 		 788 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  20.28 
 
 		 796 aa  54.7  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  22.58 
 
 		 771 aa  55.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>