70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0046 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
451 aa  933    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  47.82 
 
 
1145 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  44.84 
 
 
1140 aa  359  5e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  27.29 
 
 
455 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  28.77 
 
 
222 aa  93.6  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  24.89 
 
 
453 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  31.13 
 
 
261 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  24.13 
 
 
452 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  28.37 
 
 
241 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  28.37 
 
 
230 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  24.63 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  32.5 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  27.85 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  28.46 
 
 
238 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  27.62 
 
 
239 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  26.7 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.08 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  28.89 
 
 
247 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  24.82 
 
 
453 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  28.23 
 
 
240 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  28.7 
 
 
1194 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  26.89 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  25.93 
 
 
239 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  28.96 
 
 
322 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  29.41 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  24.63 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  29.25 
 
 
1444 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 
242 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  25.73 
 
 
216 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.63 
 
 
1505 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  28.06 
 
 
257 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  29.95 
 
 
321 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  25.78 
 
 
424 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  24.7 
 
 
268 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  25.22 
 
 
254 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  25.71 
 
 
209 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  27.5 
 
 
197 aa  61.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  28.22 
 
 
240 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  25.79 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  27.78 
 
 
308 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  24.68 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  25.79 
 
 
198 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  23.37 
 
 
352 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  28.17 
 
 
501 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  25.1 
 
 
255 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  23.41 
 
 
234 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  24.29 
 
 
272 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 
217 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  27.15 
 
 
1046 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  28.74 
 
 
215 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  25.34 
 
 
290 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  27.31 
 
 
255 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  27.78 
 
 
211 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  27.98 
 
 
259 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  25.21 
 
 
254 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  26.56 
 
 
198 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  21.33 
 
 
229 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  25.27 
 
 
281 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  24.57 
 
 
234 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  22.94 
 
 
247 aa  47  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  26.51 
 
 
313 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  37.33 
 
 
558 aa  46.6  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  26.54 
 
 
482 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
212 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  22.13 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  24.75 
 
 
193 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  25.33 
 
 
218 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  26.51 
 
 
515 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  24.45 
 
 
269 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>