64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0039 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0039  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2470  hypothetical protein  41.96 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0416551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1136  hypothetical protein  44.62 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0979  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  43.08 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551667  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1075  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.31 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1956  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.16 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5602  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  46.51 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0446  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.09 
 
 		 148 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000307298  normal  0.666062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3137  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.21 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0725  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  39.1 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113671 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2796  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.87 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2291  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.76 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10983  YuxK  36.09 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1916  hypothetical protein  39.86 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0290522  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1854  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.86 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0261  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  36.84 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.829809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.98 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0473  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.42 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1681  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  42.25 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30877  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1648  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.43 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2114  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.66 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3156  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.81 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0864  hypothetical protein  37.06 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0785  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2511  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.81 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1837  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.88 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1701  hypothetical protein  34.81 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2536  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.4 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2331  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.65 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2413  hypothetical protein  34.07 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2915  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.56 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.028233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0264  hypothetical protein  37.78 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1003  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.3 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0436  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.5 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0109  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.59 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0620  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.52 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2456  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.12 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2420  hypothetical protein  29.77 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2528  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.51 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26844  predicted protein  34.04 
 
 		 184 aa  72  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194274  normal  0.406629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3455  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.82 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4436  hypothetical protein  30.23 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.065314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2751  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.06 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3619  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.55 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204045  decreased coverage  0.00487281 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0117  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.05 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4993  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0724  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.37 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2517  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.35 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340131  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1749  hypothetical protein  28.91 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2214  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.935688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2176  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.253069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0670  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.08 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0149523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0714  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2336  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.16 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49720  hypothetical protein  27.87 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6276  hypothetical protein  27.97 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247073  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  25.41 
 
 		 130 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  25.41 
 
 		 130 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  25.71 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  26.47 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3193  hypothetical protein  26.98 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000168358  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  24.11 
 
 		 128 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.35 
 
 		 147 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0206301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>