20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0034 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0034  biotin apo-protein ligase-related protein  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1337  Biotin-protein ligase-like protein  26.05 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0286  hypothetical protein  35.71 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06055  biotin apo-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09550)  38.33 
 
 
713 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0305  biotin apo-protein ligase-related protein  40.38 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.568618  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69676  biotin holocarboxylase synthetase  23.27 
 
 
675 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0370  glutamine amidotransferase subunit PdxT  31.96 
 
 
197 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4499  biotin apo-protein ligase-related protein  29 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2764  hypothetical protein  33.78 
 
 
425 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.949617 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2239  hypothetical protein  41.3 
 
 
453 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00800  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase, putative  34.55 
 
 
789 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1126  hypothetical protein  26.11 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1200  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH  33.33 
 
 
203 aa  43.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2074  hypothetical protein  29.76 
 
 
491 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  32 
 
 
204 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2451  hypothetical protein  37.31 
 
 
414 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0250  hypothetical protein  42.22 
 
 
425 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2840  hypothetical protein  44.74 
 
 
423 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0275231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10810  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  31.51 
 
 
191 aa  42  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  46.94 
 
 
840 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>