29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0030 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
237 aa  476  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  26.56 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  24.68 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  28.02 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25.86 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  24.66 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  25.13 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  25.22 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  27.22 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  21.18 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  24.89 
 
 
238 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  23.98 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  23.91 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  23.27 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  24.64 
 
 
251 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  24.55 
 
 
238 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  27.41 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  23.53 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  23.11 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  27.78 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  30.23 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  25.84 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  28.71 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.17 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  23.35 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  25 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  24.29 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  28.11 
 
 
246 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  33.96 
 
 
254 aa  42  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>