More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0008 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0008  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  100 
 
 
501 aa  1035    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.273138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
1415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.68 
 
 
587 aa  114  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1389  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
752 aa  113  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214576  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  32.09 
 
 
623 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.87 
 
 
553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.24 
 
 
1044 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 
990 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 
1479 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5516  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
569 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
517 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.14 
 
 
1262 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
700 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  33 
 
 
614 aa  109  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
653 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0821  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.97 
 
 
525 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.97 
 
 
661 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.88 
 
 
613 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
612 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  33.18 
 
 
658 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 
614 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 
862 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2849  tyrosine protein kinase  25.34 
 
 
975 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.272735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 
1435 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
646 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 
344 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5811  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
621 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.72 
 
 
833 aa  106  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  30.07 
 
 
625 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  29.23 
 
 
668 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.22 
 
 
647 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
615 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
624 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
624 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 
703 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 
641 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
524 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
624 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
650 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
691 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 
642 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.28 
 
 
601 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  30.19 
 
 
519 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 
982 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
707 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  29.71 
 
 
625 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
498 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.88 
 
 
700 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  30.73 
 
 
672 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  33.02 
 
 
618 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
573 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
985 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 
651 aa  102  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.84 
 
 
603 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.66 
 
 
676 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
503 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.03 
 
 
1023 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6196  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 
1414 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  29.82 
 
 
626 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.8 
 
 
598 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.31 
 
 
943 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.99 
 
 
822 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
513 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  29.54 
 
 
951 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
695 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.43 
 
 
518 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.18 
 
 
664 aa  100  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.21 
 
 
1609 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
419 aa  100  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.22 
 
 
635 aa  100  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 
1289 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.43 
 
 
854 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
450 aa  100  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
598 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0290  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
601 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 
700 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
590 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
766 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 
569 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
612 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.86 
 
 
503 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  34.47 
 
 
608 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.62 
 
 
1856 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  31.08 
 
 
623 aa  99  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  31.3 
 
 
621 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.66 
 
 
476 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.36 
 
 
662 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 
734 aa  98.2  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
891 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
646 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2424  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.37 
 
 
986 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.918325  normal  0.204979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.21 
 
 
841 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
615 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.89 
 
 
896 aa  97.8  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.96 
 
 
681 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0986  serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 
612 aa  97.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.640766  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  29.29 
 
 
615 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 
651 aa  97.4  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>