49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3647 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  30.13 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  28.51 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  27.59 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  27.2 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  27.92 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  26.82 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  26.86 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  24.14 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  27.17 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  24.9 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  25.29 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  26.02 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  24.63 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  28.74 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  27.23 
 
 
267 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  26.67 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  24.61 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  25.89 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  26.97 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  26.4 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  27.16 
 
 
270 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  27.16 
 
 
270 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  27.47 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  34.15 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  25.63 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  27.69 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  27.5 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  27.5 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  27.5 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  25.4 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  27.17 
 
 
262 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  25 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  27.17 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  25 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  25.81 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  25 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  27.17 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  24.08 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  25 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  26.98 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  26.88 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  32.76 
 
 
271 aa  45.4  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  29.89 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  32.76 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  25.19 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  30.59 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  23.98 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  29.27 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>