More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3621 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
557 aa  1084    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  45.65 
 
 
541 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  44.34 
 
 
535 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  46.46 
 
 
536 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  44.3 
 
 
536 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  44.59 
 
 
536 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  45.88 
 
 
534 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  45.51 
 
 
540 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  44.72 
 
 
536 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  46.47 
 
 
556 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  48.04 
 
 
567 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  47.6 
 
 
567 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  45.55 
 
 
543 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  42.2 
 
 
576 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  41.94 
 
 
532 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  43.19 
 
 
532 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  42.99 
 
 
532 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  45.71 
 
 
566 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  44.83 
 
 
553 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  42.37 
 
 
550 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  43.58 
 
 
528 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  40.47 
 
 
534 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  40.2 
 
 
534 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  40.68 
 
 
523 aa  323  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  40.68 
 
 
523 aa  323  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  39.61 
 
 
543 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  36.24 
 
 
541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  40 
 
 
531 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  39.36 
 
 
502 aa  289  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  38.29 
 
 
537 aa  283  8.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  38.95 
 
 
528 aa  266  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  41.52 
 
 
495 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  41.56 
 
 
495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  32.97 
 
 
488 aa  248  1e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  39.01 
 
 
508 aa  249  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  40 
 
 
495 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  33.27 
 
 
501 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  34.79 
 
 
525 aa  236  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  37.85 
 
 
487 aa  225  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  39.25 
 
 
497 aa  217  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  34.73 
 
 
588 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.88 
 
 
573 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  33.14 
 
 
522 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  32 
 
 
472 aa  183  6e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  34.84 
 
 
516 aa  183  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  35.18 
 
 
506 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  34.54 
 
 
542 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  36.71 
 
 
509 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
522 aa  177  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.87 
 
 
509 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
524 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 
524 aa  172  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 
529 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 
529 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 
529 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 
529 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  32.47 
 
 
506 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
521 aa  170  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  31.49 
 
 
509 aa  170  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 
537 aa  170  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  31.75 
 
 
505 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  30.92 
 
 
529 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  32 
 
 
512 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  31.54 
 
 
515 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  31.54 
 
 
515 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  31.54 
 
 
515 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  31.81 
 
 
505 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  31.68 
 
 
505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  36.22 
 
 
524 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  31.83 
 
 
509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  26.76 
 
 
523 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  32.88 
 
 
511 aa  166  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29 
 
 
519 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  32.14 
 
 
505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  30.84 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  30.84 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  32.19 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  31.03 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  28.54 
 
 
520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  30.84 
 
 
512 aa  165  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  34.99 
 
 
505 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  30.46 
 
 
512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  30.27 
 
 
512 aa  162  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  32.58 
 
 
502 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  28.76 
 
 
516 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  33.06 
 
 
522 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
518 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  30.57 
 
 
507 aa  161  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 
479 aa  161  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  28.76 
 
 
553 aa  160  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  32.84 
 
 
520 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  32.39 
 
 
505 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  31.1 
 
 
506 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 
510 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  31 
 
 
523 aa  158  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  29.14 
 
 
516 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  28.47 
 
 
515 aa  157  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  28.39 
 
 
519 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>