More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3620 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  630  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  48.66 
 
 		 375 aa  264  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  49.83 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  47.81 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  47.12 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  48.03 
 
 		 386 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  46.8 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  43.58 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  50.71 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  44.22 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  47.64 
 
 		 324 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  42.9 
 
 		 382 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  42.9 
 
 		 382 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  41.77 
 
 		 420 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  55.51 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  51.07 
 
 		 289 aa  236  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  45.22 
 
 		 373 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  43.62 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  54.79 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  45.65 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  44.51 
 
 		 373 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  42.09 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  47.1 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  44 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  47.32 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  44.17 
 
 		 374 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  48.36 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  46.76 
 
 		 342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  42.86 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  46.59 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  50.82 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  43.2 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  45.05 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  44.3 
 
 		 383 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.87 
 
 		 340 aa  208  9e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  47.95 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  47.95 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  41.5 
 
 		 435 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  46.15 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  45.58 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  50.23 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  38.66 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  37.6 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  38.06 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  37.96 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  40.23 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  38.59 
 
 		 285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  37.35 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  38.4 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  39.83 
 
 		 421 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  36.78 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 444 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  39.22 
 
 		 275 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  37.19 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  42.31 
 
 		 483 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  38.75 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  40 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  35.71 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  39.15 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  40.85 
 
 		 425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  37.2 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  41.35 
 
 		 430 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  42.13 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  40.17 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  39.32 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  39.23 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  38.8 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  35.93 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  39.02 
 
 		 490 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  37.3 
 
 		 447 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1027  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  42.52 
 
 		 443 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  36.84 
 
 		 456 aa  152  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  39.75 
 
 		 484 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  38.59 
 
 		 287 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  36.36 
 
 		 420 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  38.54 
 
 		 434 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  38.17 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  36.44 
 
 		 421 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  38.59 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  37.05 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  39.26 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  38.32 
 
 		 371 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  33.74 
 
 		 455 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  40.26 
 
 		 464 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  36.24 
 
 		 291 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  36.44 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  34.4 
 
 		 446 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  36.97 
 
 		 447 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.52 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  35.69 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  35.27 
 
 		 291 aa  149  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  39.74 
 
 		 464 aa  148  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  39.58 
 
 		 442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  35.89 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  36.4 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  33.33 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>