More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3619 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  43.64 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  46.63 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  45.61 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  45.51 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  45.51 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  47.85 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  43.35 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  44.25 
 
 		 168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  47.83 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  43.7 
 
 		 159 aa  121  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  47.24 
 
 		 195 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  43.7 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  48.1 
 
 		 168 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  45.9 
 
 		 158 aa  119  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  44.58 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  49.37 
 
 		 167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  44.58 
 
 		 161 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  47.29 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  43.94 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  49.17 
 
 		 171 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  47.2 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  49.59 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  48.33 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  44.19 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  52 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  41.83 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  49.59 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  48.76 
 
 		 147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  46.21 
 
 		 157 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  46.11 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  44.19 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  43.98 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  46.1 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  47.29 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  52.42 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  47.5 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  45.6 
 
 		 154 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  45.6 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  44.7 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  47.29 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  44.7 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  43.56 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  44.7 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  44.7 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  45.74 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  43.94 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  52.07 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  45.97 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  43.41 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  41.61 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  46.01 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  42.33 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  48.41 
 
 		 161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  43.57 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  48.8 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  46.58 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  42.94 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  48.41 
 
 		 161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  42.47 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  45.45 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  43.8 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  50.4 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  43.95 
 
 		 149 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  44.1 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  45.7 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  45.77 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  43.28 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  43.8 
 
 		 157 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  48.33 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  45.31 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  50.47 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  43.36 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  47.69 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  48.6 
 
 		 154 aa  101  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  43.09 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  39.61 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  40.65 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  98.6  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  41.67 
 
 		 152 aa  98.6  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  45.06 
 
 		 169 aa  98.2  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50.93 
 
 		 274 aa  97.8  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  37.93 
 
 		 161 aa  97.4  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  37.36 
 
 		 189 aa  97.4  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  46.51 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  38.06 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  48.46 
 
 		 153 aa  95.9  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  39.73 
 
 		 158 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  39.73 
 
 		 158 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  44.62 
 
 		 167 aa  95.5  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  44.7 
 
 		 155 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  44.7 
 
 		 155 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  44.7 
 
 		 155 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  44.7 
 
 		 155 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  44.7 
 
 		 155 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  41.61 
 
 		 153 aa  94.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  44.7 
 
 		 155 aa  94.7  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  43.94 
 
 		 155 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  47.62 
 
 		 205 aa  94.4  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>