More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3599 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  59.93 
 
 		 880 aa  983    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  55.95 
 
 		 916 aa  877    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  57.53 
 
 		 905 aa  846    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  46.2 
 
 		 820 aa  746    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  59.98 
 
 		 910 aa  1018    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  51.77 
 
 		 904 aa  770    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  54.53 
 
 		 904 aa  890    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  59.62 
 
 		 910 aa  1015    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 		 872 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  49.89 
 
 		 882 aa  670    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  56.12 
 
 		 896 aa  877    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  44.32 
 
 		 804 aa  728    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  58.18 
 
 		 921 aa  922    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  60.14 
 
 		 888 aa  986    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  58 
 
 		 929 aa  889    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 908 aa  1793    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  58.1 
 
 		 875 aa  911    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  59.73 
 
 		 898 aa  1016    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  58.63 
 
 		 878 aa  916    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  58.98 
 
 		 876 aa  909    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  61.32 
 
 		 929 aa  963    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 		 869 aa  642    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  59.84 
 
 		 911 aa  966    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  50.9 
 
 		 858 aa  764    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  42.61 
 
 		 815 aa  645    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  43.96 
 
 		 804 aa  720    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  57.87 
 
 		 877 aa  918    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  59.93 
 
 		 908 aa  983    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  50.66 
 
 		 873 aa  707    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  59.12 
 
 		 882 aa  969    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  57.89 
 
 		 910 aa  970    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  58.91 
 
 		 923 aa  976    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  59.05 
 
 		 907 aa  985    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  59.46 
 
 		 883 aa  998    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  58.62 
 
 		 879 aa  937    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  51.24 
 
 		 864 aa  786    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  58.56 
 
 		 877 aa  931    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 		 870 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  54.26 
 
 		 919 aa  892    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  59 
 
 		 881 aa  948    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  55.12 
 
 		 914 aa  932    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  56.59 
 
 		 925 aa  878    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  60.61 
 
 		 915 aa  970    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  58.32 
 
 		 880 aa  914    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  55.72 
 
 		 897 aa  866    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  55.62 
 
 		 916 aa  872    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  57.6 
 
 		 962 aa  885    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  60.4 
 
 		 907 aa  989    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  44.83 
 
 		 868 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 		 872 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 		 872 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.09 
 
 		 871 aa  631  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 873 aa  623  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.35 
 
 		 932 aa  622  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  38.51 
 
 		 870 aa  617  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.08 
 
 		 891 aa  617  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  43.26 
 
 		 851 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  47.7 
 
 		 882 aa  615  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  43.07 
 
 		 854 aa  615  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 869 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 863 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 870 aa  611  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  41.75 
 
 		 863 aa  611  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 		 851 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.84 
 
 		 889 aa  608  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  37.78 
 
 		 896 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 		 854 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 		 851 aa  605  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 		 854 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 852 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.54 
 
 		 859 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 		 851 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 900 aa  600  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  45.59 
 
 		 882 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 		 902 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 892 aa  600  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 887 aa  599  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  43.37 
 
 		 859 aa  599  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 		 882 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 853 aa  599  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  47.82 
 
 		 882 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 858 aa  596  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 		 884 aa  598  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 		 884 aa  598  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.55 
 
 		 878 aa  598  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  47.46 
 
 		 882 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 881 aa  597  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 927 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 858 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 		 853 aa  595  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.85 
 
 		 904 aa  595  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 880 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  43.37 
 
 		 865 aa  591  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 862 aa  592  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 871 aa  590  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  41.35 
 
 		 859 aa  592  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  37.6 
 
 		 863 aa  588  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 855 aa  587  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 855 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>