More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3595 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
744 aa  1474    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
745 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
757 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 
752 aa  435  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
754 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.72 
 
 
686 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 
700 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  41.58 
 
 
693 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
676 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
1363 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 
708 aa  363  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
713 aa  360  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.11 
 
 
636 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.93 
 
 
852 aa  349  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.31 
 
 
649 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1369 aa  347  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  42.78 
 
 
847 aa  347  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
1069 aa  346  7e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  41.94 
 
 
977 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
744 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1165 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.93 
 
 
876 aa  337  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 
812 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1326 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.99 
 
 
946 aa  335  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  39.61 
 
 
650 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.16 
 
 
1135 aa  333  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  42.01 
 
 
923 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
1266 aa  330  6e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
927 aa  330  8e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1118 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 
1398 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
916 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
1548 aa  328  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1267 aa  328  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
1788 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 
835 aa  327  7e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.55 
 
 
1433 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
1313 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
833 aa  325  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1582 aa  325  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.43 
 
 
2213 aa  324  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
1202 aa  324  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
1284 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.79 
 
 
1331 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
1611 aa  321  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
929 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
1310 aa  320  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
1131 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.77 
 
 
1407 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
1397 aa  317  7e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
1340 aa  316  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
1622 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1771 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  37.26 
 
 
1014 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1767 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1767 aa  313  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  36.49 
 
 
1287 aa  313  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.06 
 
 
1442 aa  312  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
1245 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 
921 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  32.22 
 
 
1765 aa  311  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  35.75 
 
 
765 aa  310  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
816 aa  310  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1784 aa  310  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
977 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
818 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
1767 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 
957 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
1287 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.49 
 
 
1683 aa  308  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
1792 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1305 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
920 aa  307  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  33.47 
 
 
1364 aa  306  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
950 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
925 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
778 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 
1820 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  41.21 
 
 
647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
2654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 
1033 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 
1782 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
1040 aa  303  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
1550 aa  303  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
705 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
770 aa  303  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 
1128 aa  303  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
1240 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
830 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
801 aa  302  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  36.62 
 
 
1030 aa  302  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  35.87 
 
 
1574 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  40.62 
 
 
531 aa  302  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  35.76 
 
 
819 aa  301  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 
1090 aa  301  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
1240 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  41.51 
 
 
750 aa  301  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
1193 aa  300  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  34.87 
 
 
761 aa  300  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>