39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3566 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  440  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  42.01 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  38.7 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  45.98 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  39.57 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  36.86 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  38.7 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  38.7 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  36.55 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  41.26 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  40.36 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  39.38 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  39.91 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  44.44 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  34.32 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  36.13 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  35.29 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  41.21 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  35.17 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  36.24 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  38.03 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  33.05 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  33.77 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  38.96 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  40.81 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  34.76 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  38.57 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  39.35 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  36.68 
 
 		 236 aa  114  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  35.4 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  35.81 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  42.93 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  33.66 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  30.65 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  30.97 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  26.83 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1886  hypothetical protein  27.53 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.790307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2065  hypothetical protein  26.77 
 
 		 291 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>