More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3537 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 259 aa  507  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 259 aa  507  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  57.85 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  57.83 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  56.12 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  53.36 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  57.02 
 
 		 240 aa  228  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  59.02 
 
 		 231 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  59.09 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  53.02 
 
 		 310 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  52.57 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  52.16 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  54.44 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  53.82 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  49.62 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  57.22 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  53.88 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  49.77 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  56.83 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  52.25 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  47.62 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  59.06 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  51.23 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  60.81 
 
 		 242 aa  168  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  57.79 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  57.86 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  51.72 
 
 		 197 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  54.25 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  51.25 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  49.75 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  45.41 
 
 		 338 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  52.78 
 
 		 439 aa  141  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  49.69 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  46.43 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  46.76 
 
 		 460 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  46.27 
 
 		 484 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  53.12 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  51.45 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  43.17 
 
 		 234 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  54.17 
 
 		 120 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  41.53 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  41.46 
 
 		 174 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  40.14 
 
 		 199 aa  85.9  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  43.7 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.54 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  43.7 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  43.1 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  40.68 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  42.74 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45.38 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  40.91 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  44.54 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 146 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  39.39 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  35.33 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  35.83 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.82 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 		 196 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40.17 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  41.58 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.38 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  37.7 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  36.3 
 
 		 649 aa  72.4  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  39.23 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.3 
 
 		 649 aa  72.4  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  38.46 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  40.87 
 
 		 438 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  39.83 
 
 		 203 aa  72  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 218 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  39.53 
 
 		 197 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  40.95 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  38.02 
 
 		 716 aa  69.3  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9824  type IV system transglycosylase  39.26 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  38.46 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.67 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  36.75 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  35.88 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  36.55 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  34.97 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  40.68 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  36.09 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  43.64 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  36.44 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 661 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>