71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3316 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 274 aa  571  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.74 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.01 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.98 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  29.23 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  29.21 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  31.54 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.02 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.19 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  27.17 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.07 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.2 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  36.29 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.58 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  32 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  27.27 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  27.11 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  33.53 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.9 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.9 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.8 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.69 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.55 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  29.27 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.58 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.37 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3596  hypothetical protein  24.37 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.1 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.11 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  30.39 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.31 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  26.63 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.37 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.73 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.81 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.83 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.74 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 		 257 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 		 320 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.23 
 
 		 387 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.97 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.14 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.36 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  24.58 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.2 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.22 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.1 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.1 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  22.71 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.98 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  22.87 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  22.87 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.1 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  22.41 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.95 
 
 		 398 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  23.45 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  24.85 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.18 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1417  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.93 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0573  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.32 
 
 		 237 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>