More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3303 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3303  acyltransferase 3  100 
 
 		 389 aa  771    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198239  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  46.49 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  30.59 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  35.45 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  35.71 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  35.45 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4396  acyltransferase 3  32.28 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3971  acyltransferase 3  32.28 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3558  acyltransferase 3  34.11 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0624798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  34.13 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  33.43 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  33.79 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  28.54 
 
 		 392 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  32.76 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2114  acyltransferase 3  34.45 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  34.26 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  28.61 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  27.33 
 
 		 360 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2433  putative acyltransferase  32.07 
 
 		 352 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142422  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0757  acyltransferase family protein  32.07 
 
 		 352 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  28.72 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0541  acyltransferase family protein  32.07 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1708  acyltransferase family protein  32.07 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110061  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1661  acyltransferase family protein  32.07 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2294  putative acyltransferase  32.07 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0691  acyltransferase family protein  31.96 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244705  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1869  acyltransferase family protein  32.07 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  27.66 
 
 		 584 aa  86.7  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  28.15 
 
 		 671 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  30.46 
 
 		 660 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  30.51 
 
 		 662 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  35.5 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  25.06 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  27.51 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  27.57 
 
 		 637 aa  79.7  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  26.57 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  26.57 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  27.62 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  27.81 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  32.37 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3532  acyltransferase 3  26.73 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  26.33 
 
 		 604 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  27.8 
 
 		 660 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  26.33 
 
 		 604 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  26.21 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  29.89 
 
 		 718 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  28.37 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  28.81 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  26.85 
 
 		 583 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  29.47 
 
 		 638 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  32.46 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  26.34 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2069  acyltransferase 3  36.02 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  28.86 
 
 		 629 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  28.08 
 
 		 695 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.15 
 
 		 647 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  31.58 
 
 		 679 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  29.33 
 
 		 645 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  27.14 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  26.74 
 
 		 695 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  27.94 
 
 		 679 aa  70.5  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  26.12 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.1 
 
 		 656 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  27.27 
 
 		 603 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  28.52 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  29.94 
 
 		 662 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  29.12 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  28 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  29.26 
 
 		 660 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  28.28 
 
 		 629 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  30.27 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  29.82 
 
 		 665 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  24.55 
 
 		 713 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  32 
 
 		 658 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  30 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  29.45 
 
 		 667 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  30.24 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  27.27 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  27.67 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  29.32 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  32.11 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  27.44 
 
 		 690 aa  64.3  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  34.92 
 
 		 977 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  27.97 
 
 		 629 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  24.83 
 
 		 622 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  22.98 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  34.63 
 
 		 685 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  25.79 
 
 		 683 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  33.85 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  28.27 
 
 		 673 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  33.85 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  25.48 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  33.85 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  29.24 
 
 		 671 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  37.16 
 
 		 684 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  27.84 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0830  acyltransferase 3  29.1 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  24.29 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3186  acyltransferase family protein  33.85 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>