More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3192 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.35 
 
 
252 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.68 
 
 
252 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.47 
 
 
252 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.25 
 
 
252 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.78 
 
 
252 aa  308  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.2 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.94 
 
 
255 aa  305  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.71 
 
 
254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.63 
 
 
251 aa  304  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  65.94 
 
 
257 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.29 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.32 
 
 
252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.18 
 
 
252 aa  301  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  60.08 
 
 
247 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  59.24 
 
 
247 aa  294  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  61.57 
 
 
266 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  58.61 
 
 
255 aa  293  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.56 
 
 
244 aa  292  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  64.63 
 
 
267 aa  292  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.32 
 
 
248 aa  291  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  63.16 
 
 
259 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  63.16 
 
 
259 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  63.76 
 
 
259 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  59.47 
 
 
254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.12 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  53.94 
 
 
243 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  56.71 
 
 
261 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.84 
 
 
248 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.59 
 
 
241 aa  260  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  51.41 
 
 
251 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  51.79 
 
 
251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  51.41 
 
 
251 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  51.41 
 
 
251 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  51 
 
 
251 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.92 
 
 
248 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  50.41 
 
 
261 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  57.46 
 
 
228 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
251 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  56.54 
 
 
260 aa  255  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.38 
 
 
253 aa  255  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.38 
 
 
253 aa  255  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.25 
 
 
251 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  50.6 
 
 
251 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.81 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  52.81 
 
 
256 aa  252  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.85 
 
 
236 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.45 
 
 
252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.33 
 
 
259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  51.26 
 
 
264 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.33 
 
 
251 aa  250  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  52.56 
 
 
236 aa  249  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
236 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.71 
 
 
243 aa  249  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.3 
 
 
249 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
248 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.54 
 
 
246 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  52.56 
 
 
244 aa  247  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.88 
 
 
249 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.09 
 
 
257 aa  246  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
240 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  53.31 
 
 
245 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  51.49 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
282 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1164  undecaprenyl diphosphate synthase  56.07 
 
 
253 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  48.18 
 
 
247 aa  242  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.68 
 
 
256 aa  242  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
248 aa  242  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  52.19 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.61 
 
 
257 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.73 
 
 
246 aa  241  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
234 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.18 
 
 
256 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  48.9 
 
 
259 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  55.26 
 
 
254 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.08 
 
 
258 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.39 
 
 
247 aa  239  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.16 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.25 
 
 
258 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.25 
 
 
258 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.25 
 
 
258 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 
261 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.25 
 
 
258 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.25 
 
 
258 aa  238  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.25 
 
 
258 aa  238  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.08 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  47.21 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  49.38 
 
 
260 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.25 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  51.93 
 
 
241 aa  238  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.36 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.98 
 
 
267 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.38 
 
 
260 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>