More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3122 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3122  inositol monophosphatase  100 
 
 
276 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.537848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2434  inositol monophosphatase  45.34 
 
 
268 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1331  inositol monophosphatase  41.2 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  0.102778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0440  inositol monophosphatase  38.17 
 
 
270 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1687  inositol monophosphatase  41.73 
 
 
272 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0369  inositol monophosphatase  38.76 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1943  inositol monophosphatase  42.25 
 
 
274 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910476  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1934  inositol monophosphatase family protein  37.88 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2393  inositol monophosphatase  38.22 
 
 
275 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1511  inositol monophosphatase  39.46 
 
 
274 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27030  Inositol monophosphatase  39.38 
 
 
274 aa  158  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0825  inositol monophosphatase family protein  40.55 
 
 
275 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0832  inositol monophosphatase family protein  40.55 
 
 
275 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2152  inositol monophosphatase  38.08 
 
 
274 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3030  inositol monophosphatase  34.3 
 
 
293 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0638536  normal  0.49739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1995  inositol monophosphatase  39.32 
 
 
269 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2683  inositol-phosphate phosphatase  37.59 
 
 
266 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169796  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1760  inositol monophosphatase  37.55 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.538338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0059  inositol monophosphatase  33.59 
 
 
271 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0480  inositol monophosphatase  39 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  decreased coverage  0.000552939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1944  inositol monophosphatase  37.36 
 
 
275 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0143243  normal  0.761582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2153  inositol monophosphatase  37.65 
 
 
275 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2346  inositol monophosphatase  38.67 
 
 
276 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.960977  normal  0.160347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1933  inositol monophosphatase family protein  34.94 
 
 
278 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7112  inositol monophosphatase  33.96 
 
 
273 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0508739  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1437  inositol monophosphatase  33.47 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224177  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3111  inositol monophosphatase  31.8 
 
 
269 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  hitchhiker  0.000300564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3188  inositol monophosphatase  33.33 
 
 
266 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000102923  hitchhiker  0.0000000006834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1499  inositol monophosphatase  32.37 
 
 
269 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270636  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3254  inositol monophosphatase family protein  32.49 
 
 
275 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2855  Inositol-phosphate phosphatase  32.49 
 
 
275 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0377  inositol monophosphatase  35.02 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  31 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  32.9 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1308  inositol monophosphatase  31.1 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.730975  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  29.43 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  30.97 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  29.85 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1378  inositol monophosphatase  31.1 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  31.71 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  31.78 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  31.78 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  31.78 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.91 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  31.78 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  31.17 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  27.27 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  29.96 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01052  hypothetical protein  30.16 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0158  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.07 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  31.22 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  29.69 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  31.36 
 
 
267 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  31.36 
 
 
267 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  31.36 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  29.07 
 
 
267 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  31.36 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  29.6 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  30.13 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  29.96 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  30.26 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  30.93 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4077  inositol monophosphatase family protein  31.55 
 
 
263 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4005  inositol monophosphatase family protein  31.55 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000418119  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0561  Inositol-phosphate phosphatase  30.61 
 
 
268 aa  87  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4061  inositol monophosphatase family protein  31.07 
 
 
261 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3718  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.55 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000237867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3703  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.55 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3973  inositol monophosphatase family protein  31.55 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  30.74 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3870  inositol monophosphatase family protein  31.55 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4168  inositol monophosphatase family protein  31.55 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000260385  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  30.77 
 
 
267 aa  85.9  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1841  inositol monophosphatase  31.19 
 
 
264 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0246  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.57 
 
 
275 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0802  Inositol-phosphate phosphatase  27.09 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  30.14 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  29.13 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  28.74 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0673  Inositol-phosphate phosphatase  32.58 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  28.34 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  31.53 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0603  Inositol-phosphate phosphatase  31.75 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  30.51 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  29.13 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2471  inositol monophosphatase family protein  30.4 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2273  inositol monophosphatase  26.97 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0668825  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0222  inositol monophosphatase  34.16 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.320953 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  29.46 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  28.7 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  27.52 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  30.89 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  29.46 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  29.63 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  31.09 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  29.05 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3256  Inositol-phosphate phosphatase  30.87 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0330057  normal  0.162821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  29.92 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2981  inositol-phosphate phosphatase  30.17 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1179  inositol monophosphatase family protein  30.58 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>