More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3102 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
205 aa  420  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  61.58 
 
 
203 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  60.1 
 
 
203 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  58.62 
 
 
203 aa  264  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  57.84 
 
 
216 aa  249  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.51 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.05 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  35.27 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  38.83 
 
 
186 aa  131  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 
208 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.81 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  36.89 
 
 
208 aa  124  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 
208 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.75 
 
 
202 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 
205 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  35.92 
 
 
208 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 
208 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.44 
 
 
208 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  33.66 
 
 
203 aa  117  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  38.39 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  37.5 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.02 
 
 
204 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  33.18 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.78 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  33.96 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  34.91 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.62 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  32.08 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.24 
 
 
205 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  32.34 
 
 
203 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  32.51 
 
 
204 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 
230 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.06 
 
 
231 aa  101  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.4 
 
 
230 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  29.85 
 
 
204 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  33.51 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.41 
 
 
211 aa  98.6  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.48 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  31.16 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.19 
 
 
237 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6065  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 
232 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.28 
 
 
214 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  29.61 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.31 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  30.85 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.35 
 
 
224 aa  85.1  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  28.64 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  30.69 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  29.65 
 
 
229 aa  81.3  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  30.99 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  31.34 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  29.95 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1435  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53764  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.27 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  29.35 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.5 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.87 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  29.95 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3548  glutathione S-transferase  27.27 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0628604  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  32.86 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.37 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  26.87 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  27.18 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  27.86 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  30.54 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.35 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  32 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  32 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  28.36 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  32 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.87 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  31 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  25.74 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  28.79 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.38 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.87 
 
 
214 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  27.87 
 
 
214 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  27.72 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  30.81 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  30.92 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.87 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.87 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  26.21 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  30.39 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.22 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.22 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.36 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  28.28 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>