286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3035 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
104 aa  209  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  58.76 
 
 
114 aa  119  1e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  56.12 
 
 
115 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  54.46 
 
 
118 aa  115  1e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  55.45 
 
 
110 aa  115  2e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  55.45 
 
 
110 aa  115  2e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  55.45 
 
 
113 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  58.43 
 
 
146 aa  113  9e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  54.74 
 
 
144 aa  113  1e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  53 
 
 
111 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  55.79 
 
 
113 aa  111  4e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  55.79 
 
 
113 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  51.04 
 
 
133 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  52.63 
 
 
133 aa  110  8e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  53.76 
 
 
111 aa  109  1e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  54.95 
 
 
142 aa  109  1e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  51.58 
 
 
110 aa  108  2e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  54.95 
 
 
146 aa  108  2e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  59.34 
 
 
110 aa  109  2e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  55.21 
 
 
94 aa  107  7e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  54.44 
 
 
111 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  52.08 
 
 
154 aa  103  8e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  51 
 
 
143 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  60.71 
 
 
105 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  57.65 
 
 
93 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  57.47 
 
 
110 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  46.81 
 
 
113 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  52.27 
 
 
110 aa  100  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  55 
 
 
115 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  57.65 
 
 
108 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  57.65 
 
 
108 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  46.88 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  55.29 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  50.55 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  49.44 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  42.11 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  43.96 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  43.96 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  43.96 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  43.96 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  43.96 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  43.96 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  43.96 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  50 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  45.12 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  43.82 
 
 
109 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  51.25 
 
 
178 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  43.62 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.2041e-07  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  46 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  48.1 
 
 
105 aa  84.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  48.1 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  44.58 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  53.25 
 
 
114 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  43.37 
 
 
108 aa  82.8  1e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  43.37 
 
 
108 aa  82.8  1e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  43.37 
 
 
108 aa  82.8  1e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  43.37 
 
 
108 aa  82.8  1e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  43.37 
 
 
108 aa  82.8  1e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  43.37 
 
 
108 aa  82.8  1e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  48.24 
 
 
114 aa  83.2  1e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  43.37 
 
 
108 aa  82.8  1e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  40.45 
 
 
120 aa  81.3  4e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  38.2 
 
 
127 aa  81.3  4e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  40.45 
 
 
109 aa  81.3  4e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  38.3 
 
 
125 aa  80.9  5e-15  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
133 aa  80.5  7e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  51 
 
 
115 aa  80.1  9e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  46.07 
 
 
117 aa  79  2e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 
107 aa  78.2  3e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  40.23 
 
 
106 aa  78.2  4e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  38.64 
 
 
108 aa  77  7e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  40.22 
 
 
168 aa  77.4  7e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
94 aa  77  8e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  43.37 
 
 
110 aa  77  9e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  43.37 
 
 
110 aa  77  9e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 
106 aa  76.6  9e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1576  preprotein translocase subunit YajC  44.3 
 
 
88 aa  77  9e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  48.65 
 
 
93 aa  76.6  1e-13  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  44.16 
 
 
93 aa  76.6  1e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  41.86 
 
 
103 aa  75.9  2e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 
109 aa  75.9  2e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
111 aa  75.5  2e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 
91 aa  75.9  2e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  37.08 
 
 
95 aa  75.5  3e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  37.89 
 
 
119 aa  75.1  3e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  46.67 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  43.53 
 
 
109 aa  74.7  4e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  46.67 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
111 aa  74.3  5e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  38.75 
 
 
91 aa  74.3  5e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
102 aa  74.3  5e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  44.59 
 
 
120 aa  74.3  5e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
111 aa  74.3  5e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 
109 aa  74.3  5e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 
111 aa  73.9  6e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  41.89 
 
 
109 aa  74.3  6e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.98451e-12  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  47.83 
 
 
111 aa  74.3  6e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 
90 aa  73.6  8e-13  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  34.69 
 
 
115 aa  73.2  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>