More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3033 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  100 
 
 		 328 aa  660    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  44.07 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  37.3 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  37.55 
 
 		 394 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  36.92 
 
 		 478 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  36.33 
 
 		 453 aa  185  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  35.71 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  37.5 
 
 		 449 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  38.35 
 
 		 484 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  50 
 
 		 465 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  39.1 
 
 		 447 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.48 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  37.82 
 
 		 530 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  37.09 
 
 		 534 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  36.19 
 
 		 427 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  35.82 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  36.65 
 
 		 251 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  36.65 
 
 		 251 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  36.65 
 
 		 251 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  36.65 
 
 		 251 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  36.65 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  37.56 
 
 		 250 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  32.23 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  36.21 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  34.08 
 
 		 438 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  35.34 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  38.25 
 
 		 248 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  35 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  36.16 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  34.96 
 
 		 397 aa  143  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  36.2 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  36.2 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  37.16 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  36.2 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  37.16 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  37.16 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  33.46 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  33.46 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  50.81 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  36.65 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  54.55 
 
 		 500 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  55.17 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  37.16 
 
 		 250 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  50.82 
 
 		 455 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  50.82 
 
 		 446 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  50.82 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  50.83 
 
 		 537 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  36.16 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  50.85 
 
 		 501 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  34.05 
 
 		 285 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  36.44 
 
 		 538 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0661  peptidase M23B  37.39 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0851983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  33.21 
 
 		 509 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  32.73 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  35.55 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  33.85 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  33.74 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0690  hypothetical protein  36.89 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  34.35 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  33.11 
 
 		 633 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  33.62 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  33.62 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  35.83 
 
 		 315 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  37.04 
 
 		 230 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  30.69 
 
 		 401 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  36.4 
 
 		 261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  31.56 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  35.95 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  32.7 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  36.82 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  32.7 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  32.7 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  32.7 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  32.7 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  38.67 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  28.18 
 
 		 602 aa  129  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  32.2 
 
 		 344 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1246  novel lipoprotein homolog NlpD  33.33 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  33.33 
 
 		 452 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  32.27 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  30.8 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  30.8 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  30.8 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  30.8 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  30.8 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  30.72 
 
 		 284 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1246  novel lipoprotein homolog NlpD  33.78 
 
 		 247 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  32.46 
 
 		 363 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  31.34 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  36.28 
 
 		 284 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  37.67 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  29.45 
 
 		 374 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  35.1 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  37.72 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  29.6 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  35.05 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  32.72 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  35.05 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  35.9 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  33.21 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>