More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2938 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  100 
 
 		 162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  74.85 
 
 		 159 aa  235  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  70.99 
 
 		 160 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  70.99 
 
 		 155 aa  233  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  70.99 
 
 		 160 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  71.6 
 
 		 158 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  68.71 
 
 		 161 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  69.75 
 
 		 160 aa  231  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  69.75 
 
 		 161 aa  230  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  70.37 
 
 		 155 aa  229  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  69.14 
 
 		 158 aa  229  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  69.94 
 
 		 155 aa  228  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  70.99 
 
 		 158 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  67.9 
 
 		 158 aa  227  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  69.33 
 
 		 160 aa  227  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  71.17 
 
 		 159 aa  227  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  69.14 
 
 		 162 aa  226  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  70 
 
 		 158 aa  225  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  69.94 
 
 		 158 aa  225  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  69.75 
 
 		 157 aa  225  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  69.94 
 
 		 158 aa  225  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  69.94 
 
 		 161 aa  223  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  69.94 
 
 		 161 aa  223  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  70.55 
 
 		 161 aa  223  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  67.9 
 
 		 162 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  69.94 
 
 		 161 aa  222  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  69.28 
 
 		 165 aa  221  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 		 155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  64.5 
 
 		 164 aa  221  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  67.48 
 
 		 163 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  64.6 
 
 		 164 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 		 165 aa  213  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  63.25 
 
 		 166 aa  210  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  65.43 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  66.05 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  65.43 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  63.64 
 
 		 158 aa  208  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  72.93 
 
 		 188 aa  207  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  71.43 
 
 		 180 aa  205  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  63.35 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  74.62 
 
 		 159 aa  201  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  63.41 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 130 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0066  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 		 152 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0388  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  56.52 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  56.45 
 
 		 130 aa  147  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  50.98 
 
 		 170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  56.45 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  144  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 129 aa  143  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 129 aa  143  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  58.06 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>