More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2863 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  65.19 
 
 		 158 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  64.43 
 
 		 158 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  65.54 
 
 		 158 aa  208  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  60.4 
 
 		 157 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  59.73 
 
 		 157 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  59.73 
 
 		 157 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  59.21 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  57.72 
 
 		 157 aa  190  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  59.24 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  62.91 
 
 		 157 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 157 aa  187  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  58.39 
 
 		 159 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  59.06 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  57.05 
 
 		 157 aa  186  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  56.38 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  56.69 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  60.27 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  60.65 
 
 		 157 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  60.65 
 
 		 157 aa  184  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  56.05 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  62.18 
 
 		 157 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  62.58 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  55.33 
 
 		 160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  62.67 
 
 		 157 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  58.6 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 155 aa  177  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  53.8 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  58 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 160 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 157 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 157 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  57.82 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  56.13 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  58.5 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  51.27 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  49.37 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  53.9 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  52.67 
 
 		 156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  51.28 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  52 
 
 		 155 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  50.97 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  53.02 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  52.26 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  49.35 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  51.66 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  50.68 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  53.02 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  53.02 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 150 aa  147  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 150 aa  147  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  51.33 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  51.68 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  48.05 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  50 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  54.14 
 
 		 153 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 157 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1365  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 148 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  52.32 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 148 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  49.04 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  48.68 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  48.37 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  50 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1301  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.928696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  48.68 
 
 		 154 aa  141  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 157 aa  141  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  48.89 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  50 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>