More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2806 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  39.93 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  37.18 
 
 		 556 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  37.79 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  37.63 
 
 		 549 aa  168  8e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  37.46 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  37.63 
 
 		 600 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  36.16 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  36.18 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  39.34 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  35.66 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  39.11 
 
 		 657 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  39.11 
 
 		 654 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  36.26 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  35.31 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  34.65 
 
 		 628 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  34.93 
 
 		 282 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  34.12 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  37.81 
 
 		 551 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  34.85 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  36.9 
 
 		 616 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  33.21 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  36.91 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  32.38 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  36.16 
 
 		 570 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  35.53 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  37.72 
 
 		 523 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  37.16 
 
 		 826 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 		 611 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.32 
 
 		 554 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  38.03 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  35.06 
 
 		 535 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  36 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  37.65 
 
 		 751 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  33.57 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  33.95 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 698 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 882 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  32.64 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.55 
 
 		 433 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  35.77 
 
 		 829 aa  126  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  33.83 
 
 		 1196 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  34.62 
 
 		 605 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  34.69 
 
 		 517 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  37.22 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  33.08 
 
 		 603 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  35.48 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.73 
 
 		 925 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  32.45 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  33.59 
 
 		 491 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  31.3 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  32.38 
 
 		 586 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  29.45 
 
 		 624 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  35.08 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  31.29 
 
 		 1104 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  31.06 
 
 		 929 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  33.58 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 617 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  34.14 
 
 		 522 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  32.92 
 
 		 636 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  32.7 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  30.42 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 664 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  33.1 
 
 		 586 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  34.51 
 
 		 742 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  35.08 
 
 		 1160 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 877 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 637 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  32.79 
 
 		 820 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 		 616 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 625 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  31.68 
 
 		 497 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  32.43 
 
 		 802 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  31.62 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  32.95 
 
 		 351 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  31.2 
 
 		 426 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  29.1 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1911 aa  112  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  31.54 
 
 		 416 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  32.42 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  34.48 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  33.61 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  33.83 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  34.41 
 
 		 351 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 639 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 639 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  31.06 
 
 		 620 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  29.26 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 637 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  30.63 
 
 		 892 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 620 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  33.97 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 		 621 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  30.29 
 
 		 1132 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  31.46 
 
 		 527 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 349 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>