More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2753 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  100 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  84.44 
 
 		 189 aa  296  8e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  89.63 
 
 		 192 aa  292  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  84.44 
 
 		 186 aa  292  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  89.63 
 
 		 192 aa  292  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  89.63 
 
 		 192 aa  291  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  89.02 
 
 		 195 aa  290  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  84.88 
 
 		 190 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  82.58 
 
 		 190 aa  287  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  85.8 
 
 		 185 aa  287  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  84.3 
 
 		 189 aa  285  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  86.59 
 
 		 191 aa  283  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  82.84 
 
 		 190 aa  280  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  81.25 
 
 		 189 aa  279  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  83.73 
 
 		 191 aa  277  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  85.8 
 
 		 192 aa  277  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  77.9 
 
 		 189 aa  276  9e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  84.34 
 
 		 185 aa  276  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  85.71 
 
 		 186 aa  274  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  85.09 
 
 		 186 aa  274  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  79.66 
 
 		 189 aa  274  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  79.41 
 
 		 201 aa  274  6e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  80.11 
 
 		 189 aa  273  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  84.24 
 
 		 191 aa  273  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  84.24 
 
 		 191 aa  273  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  77.97 
 
 		 201 aa  273  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  77.9 
 
 		 189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  83.64 
 
 		 191 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  77.06 
 
 		 199 aa  266  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  77.84 
 
 		 187 aa  266  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  80.89 
 
 		 191 aa  263  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  76.47 
 
 		 188 aa  260  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  77.25 
 
 		 187 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1732  30S ribosomal protein S5  77.25 
 
 		 187 aa  258  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0378  30S ribosomal protein S5  77.25 
 
 		 187 aa  258  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  77.16 
 
 		 197 aa  258  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  77.11 
 
 		 189 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  79.01 
 
 		 192 aa  248  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1336  30S ribosomal protein S5  74.39 
 
 		 239 aa  244  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2801  30S ribosomal protein S5  74.39 
 
 		 242 aa  234  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1266  30S ribosomal protein S5  75 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0807868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  61.05 
 
 		 172 aa  205  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  61.63 
 
 		 173 aa  204  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  58.68 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  59.2 
 
 		 172 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  61.49 
 
 		 173 aa  200  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  61.49 
 
 		 173 aa  200  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  57.47 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0067  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00817055  hitchhiker  0.00000000000110208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3464  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267646  normal  0.0371853 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0514  30S ribosomal protein S5  60.36 
 
 		 176 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0137335  unclonable  0.0000000000177209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  60.36 
 
 		 176 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 172 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 172 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 172 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 172 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 172 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2308  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 172 aa  197  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0837042  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 172 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  58.14 
 
 		 172 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 172 aa  195  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  60.87 
 
 		 172 aa  195  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  56.9 
 
 		 172 aa  194  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0854  30S ribosomal protein S5  60.37 
 
 		 166 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09020  30S ribosomal protein S5  60.37 
 
 		 166 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085618  normal  0.293269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2933  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 172 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000097006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 172 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06420  30S ribosomal protein S5  60.98 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0942299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3321  30S ribosomal protein S5  56 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3892  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 		 166 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000919521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_002978  WD0664  30S ribosomal protein S5  58.54 
 
 		 170 aa  191  6e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0314639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0643  ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 166 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00626233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4531  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 166 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00205716  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 174 aa  190  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0471  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 166 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107379  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0841  30S ribosomal protein S5  65.16 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4732  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 166 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000128716  normal  0.628759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0504  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 166 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566357  normal  0.161255 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 166 aa  190  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0501  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 166 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000260695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>