More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2735 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 104 aa  184  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  89.22 
 
 		 104 aa  184  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  89.22 
 
 		 102 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 102 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 102 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 102 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 102 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 102 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 102 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 102 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  86.27 
 
 		 102 aa  181  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 102 aa  180  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 102 aa  180  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  86.27 
 
 		 102 aa  180  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  87.25 
 
 		 102 aa  179  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  88.24 
 
 		 102 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0360  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2535  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1715  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.380329  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  83.33 
 
 		 106 aa  178  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  177  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 102 aa  177  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  177  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  85.86 
 
 		 103 aa  177  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 102 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 102 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 102 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  83.33 
 
 		 102 aa  176  8e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  86.27 
 
 		 102 aa  176  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  83.33 
 
 		 102 aa  176  8e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  83.33 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  83.33 
 
 		 102 aa  174  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  83.33 
 
 		 102 aa  173  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  78.43 
 
 		 103 aa  169  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 102 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  168  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 		 103 aa  168  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1354  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 		 103 aa  167  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.546745  normal  0.0408576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  167  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  78.22 
 
 		 101 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  78.22 
 
 		 101 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  78.22 
 
 		 101 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  78.22 
 
 		 101 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  164  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4277  ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  161  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000346918  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1248  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 103 aa  160  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  75.49 
 
 		 103 aa  160  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  159  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  159  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0625  ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000466292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4549  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000213954  normal  0.0597614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0453  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0704355  unclonable  0.000000189493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4750  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000671466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0483  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000151275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5080  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793453  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0836  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  157  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0236552  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0169  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000585443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08840  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  157  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000352676  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0486  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000131122  normal  0.0380301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3910  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00375138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0859  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 		 109 aa  157  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.591238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06240  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00394017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0147  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000495355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000277123  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  156  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  156  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  156  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00729  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001743  SSU ribosomal protein S10p (S20e)  72.55 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000127695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4545  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000155488  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4171  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000385608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0425  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000101436  hitchhiker  0.0000276478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3637  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000269105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0583  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572032  normal  0.180599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3808  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000064612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0282  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000746506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0755  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000508535  normal  0.0162488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0199  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000181945  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3745  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00135486  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3916  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.06232e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4057  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000379961  hitchhiker  0.000000000138432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0195  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000645818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0058  SSU ribosomal protein S10P  73.53 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000415336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0198  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000200655  unclonable  0.0000000000157318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0193  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000424599  decreased coverage  0.00027939 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.0000321241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000267319  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>