More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2625 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
423 aa  866    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  54.29 
 
 
433 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  54.05 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  54.05 
 
 
436 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  47.39 
 
 
425 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  52.51 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  50 
 
 
430 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  49.76 
 
 
430 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  50 
 
 
430 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  49.4 
 
 
421 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  49.76 
 
 
430 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  48.82 
 
 
430 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  49.53 
 
 
433 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  49.76 
 
 
430 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  50.24 
 
 
433 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  49.06 
 
 
436 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  49.76 
 
 
430 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  49.76 
 
 
433 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  49.76 
 
 
433 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  49.76 
 
 
433 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  47.52 
 
 
426 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  47.52 
 
 
426 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  47.28 
 
 
426 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  47.52 
 
 
426 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  47.28 
 
 
426 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  47.52 
 
 
426 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  48.81 
 
 
433 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  47.28 
 
 
426 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 
428 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  47.28 
 
 
426 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  45.13 
 
 
428 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 
435 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  47.04 
 
 
426 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  45.61 
 
 
427 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
428 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
428 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
428 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  44.21 
 
 
428 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
428 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
428 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  44.21 
 
 
428 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 
427 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 
427 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 
427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 
427 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  43.74 
 
 
428 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  44.42 
 
 
427 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  45.05 
 
 
437 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  45.86 
 
 
434 aa  361  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 
428 aa  359  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 
428 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  44.42 
 
 
427 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  44.18 
 
 
427 aa  359  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  43.74 
 
 
427 aa  358  8e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 
426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  45.37 
 
 
439 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  43.23 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  45.13 
 
 
439 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 
428 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  46.23 
 
 
431 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 
440 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  46.32 
 
 
429 aa  349  6e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 
430 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 
431 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  45.52 
 
 
431 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 
427 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 
433 aa  345  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 
427 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  45.5 
 
 
438 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  45.21 
 
 
449 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  44.66 
 
 
427 aa  343  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  43.13 
 
 
435 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 
431 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 
437 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 
428 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  44.86 
 
 
441 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 
428 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 
427 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 
436 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 
433 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  45.67 
 
 
437 aa  329  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 
437 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
453 aa  326  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
427 aa  325  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  42.18 
 
 
437 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 
427 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 
425 aa  325  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  40.76 
 
 
435 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
430 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 
430 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  39.47 
 
 
428 aa  323  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 
435 aa  323  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
435 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 
435 aa  322  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 
435 aa  322  8e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
435 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  39.23 
 
 
428 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 
435 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>