More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2612 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  45.82 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  45.6 
 
 		 254 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  44.4 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  46.37 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  44.09 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  42.28 
 
 		 250 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  45.34 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  44.69 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  41.7 
 
 		 249 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  43.62 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  42.8 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  43.31 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  43.7 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  42.45 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  38.27 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  40.98 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  42.39 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  41.73 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  40.16 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  36.21 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  33.74 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  31.45 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  31.85 
 
 		 286 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 284 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.48 
 
 		 308 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  33.06 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.76 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 284 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  35.76 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  30.04 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.7 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.94 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  32.59 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  31.85 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.66 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  30.13 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  32.53 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  29.58 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  30.17 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.87 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.44 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.74 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  31.52 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  28.5 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  39.68 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  29.96 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>