72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2607 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  48.14 
 
 		 909 aa  902    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  67.32 
 
 		 937 aa  1248    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  100 
 
 		 928 aa  1914    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  36.98 
 
 		 934 aa  645    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  45.77 
 
 		 908 aa  842    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  50.8 
 
 		 933 aa  938    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  37.7 
 
 		 871 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  37 
 
 		 914 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  36.15 
 
 		 912 aa  556  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  36.31 
 
 		 919 aa  550  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  37.29 
 
 		 916 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  35.99 
 
 		 941 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  38.85 
 
 		 929 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  37.69 
 
 		 934 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  37.8 
 
 		 955 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  33.41 
 
 		 926 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  32.95 
 
 		 928 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.29 
 
 		 929 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  32.16 
 
 		 926 aa  429  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  32.12 
 
 		 932 aa  429  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  31.57 
 
 		 928 aa  418  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.76 
 
 		 918 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  31.91 
 
 		 921 aa  399  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  29.89 
 
 		 909 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  30.78 
 
 		 622 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1018 aa  179  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  24.17 
 
 		 925 aa  168  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1151 aa  164  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  27.43 
 
 		 978 aa  162  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1184 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  23.16 
 
 		 1186 aa  157  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1154 aa  146  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1173 aa  145  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  26.72 
 
 		 918 aa  144  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  26.4 
 
 		 621 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  27.55 
 
 		 973 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1188 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1170 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  34.13 
 
 		 869 aa  93.6  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  49.43 
 
 		 97 aa  90.5  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1243 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1346 aa  69.3  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1347 aa  68.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1321 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  21.34 
 
 		 504 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1339 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1298 aa  60.1  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1347 aa  57  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1353 aa  54.7  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  32.67 
 
 		 430 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1231 aa  53.5  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1422 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  20.71 
 
 		 1282 aa  53.5  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1409 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1440 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1184 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1333 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1452 aa  49.3  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1039 aa  48.9  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1363 aa  48.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  22.12 
 
 		 536 aa  48.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  17.99 
 
 		 1154 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  20.81 
 
 		 1002 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  19.19 
 
 		 1290 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  22.95 
 
 		 477 aa  45.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1342 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.89 
 
 		 694 aa  45.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  26.15 
 
 		 1358 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  27.37 
 
 		 489 aa  45.1  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1373 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1622  hypothetical protein  47.06 
 
 		 53 aa  44.7  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  20.96 
 
 		 1041 aa  44.3  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>