234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2592 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2592  regulatory protein TetR  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28583  normal  0.135199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10335  hypothetical protein  32.24 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8225  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  42.59 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  33.96 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 193 aa  48.5  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  43.33 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  36.11 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  44.23 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 198 aa  45.1  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 244 aa  45.1  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 424 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  42.59 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  38.2 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>