More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2519 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  100 
 
 
507 aa  1051    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  46.69 
 
 
519 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  46.08 
 
 
519 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  46.67 
 
 
512 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  46.09 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  45.42 
 
 
514 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  35.08 
 
 
458 aa  287  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  32.25 
 
 
536 aa  256  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  29.92 
 
 
572 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  31.14 
 
 
554 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  30.9 
 
 
549 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  30.69 
 
 
518 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  29.25 
 
 
523 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  31.19 
 
 
494 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  26.6 
 
 
480 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  31.34 
 
 
526 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  28.93 
 
 
518 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  27.4 
 
 
481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  28.19 
 
 
489 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  26.69 
 
 
482 aa  148  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  27.8 
 
 
495 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.55 
 
 
537 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  30.33 
 
 
482 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  28.13 
 
 
509 aa  140  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  26.24 
 
 
587 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  27.79 
 
 
486 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  25.83 
 
 
473 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  27.87 
 
 
511 aa  137  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  27.44 
 
 
505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  27.18 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  27.45 
 
 
499 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  25.14 
 
 
496 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  26.42 
 
 
508 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  26.2 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  26.52 
 
 
498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  25.31 
 
 
515 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  27.44 
 
 
516 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  27.44 
 
 
516 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  27.76 
 
 
474 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  29.2 
 
 
535 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  25.98 
 
 
505 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  27.43 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  26.65 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  24.95 
 
 
564 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  26.25 
 
 
517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  25.7 
 
 
517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  27.1 
 
 
594 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  26.05 
 
 
517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  26.05 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  26.05 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  26.05 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  26.05 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  26.05 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  27.54 
 
 
489 aa  116  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  25.93 
 
 
497 aa  116  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  26.37 
 
 
503 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  27.11 
 
 
497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  25.99 
 
 
505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  24.54 
 
 
510 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  24.64 
 
 
505 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  28.47 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  25.69 
 
 
559 aa  114  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47845  predicted protein  26.61 
 
 
620 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0593792  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  27.27 
 
 
493 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  24.68 
 
 
503 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  25.52 
 
 
512 aa  113  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  27.94 
 
 
1041 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  25.58 
 
 
565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  24.9 
 
 
505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  32.49 
 
 
545 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  26.48 
 
 
493 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  25.73 
 
 
503 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  24.85 
 
 
501 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2095  sulfatase  25.32 
 
 
594 aa  108  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  28.37 
 
 
498 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  25.27 
 
 
496 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  25.05 
 
 
502 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  26.59 
 
 
517 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  28.89 
 
 
466 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26.05 
 
 
459 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7372  N-acetylglucosamine-6-sulfatase  26.1 
 
 
513 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.834841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  25.88 
 
 
586 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  26.35 
 
 
523 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  27.74 
 
 
476 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2621  sulfatase  25.05 
 
 
512 aa  103  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0161574  normal  0.118013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  24.64 
 
 
502 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  25.68 
 
 
504 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1248  sulfatase  25.52 
 
 
501 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  23.89 
 
 
499 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  30.21 
 
 
511 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  24.08 
 
 
467 aa  99.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  25.52 
 
 
497 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  30.77 
 
 
511 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  25.6 
 
 
478 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  22.43 
 
 
491 aa  98.2  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  25.42 
 
 
498 aa  97.8  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.79 
 
 
501 aa  97.1  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1013  sulfatase  28.83 
 
 
515 aa  96.7  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  24.71 
 
 
486 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  33.51 
 
 
478 aa  95.9  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>