More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2497 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 323 aa  671    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  52.81 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  51.05 
 
 		 334 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  48.66 
 
 		 331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  47.75 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  43.33 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  43.44 
 
 		 323 aa  262  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  42.51 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  40.19 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  40.25 
 
 		 311 aa  242  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 		 315 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 		 315 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  41.19 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  41.56 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  37.81 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  39.53 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  36.34 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  37.99 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  35.97 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  33.98 
 
 		 356 aa  169  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  31.61 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 287 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.94 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 284 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  31.55 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  30.91 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.94 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 283 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.21 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  29.38 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  28.57 
 
 		 356 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  27.22 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  30.03 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  28.43 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  27.33 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  34.54 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.94 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.57 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  40.65 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>