More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2491 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  100 
 
 
396 aa  796  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3303  acyltransferase 3  46.67 
 
 
389 aa  303  4e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198239  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  31.02 
 
 
392 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  30.79 
 
 
346 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  32.53 
 
 
364 aa  112  1e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  32.32 
 
 
354 aa  111  2e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  33.13 
 
 
354 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  30.1 
 
 
399 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  28.68 
 
 
380 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3971  acyltransferase 3  33.43 
 
 
354 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181677  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3558  acyltransferase 3  33.43 
 
 
354 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0624798  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  31.5 
 
 
366 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  30.75 
 
 
372 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  30.91 
 
 
368 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  28.22 
 
 
640 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  28.79 
 
 
660 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  27.87 
 
 
386 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  27 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4396  acyltransferase 3  34.83 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2114  acyltransferase 3  32.83 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0757  acyltransferase family protein  33.02 
 
 
352 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2433  putative acyltransferase  33.02 
 
 
352 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142422  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2294  putative acyltransferase  33.02 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1869  acyltransferase family protein  33.02 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0541  acyltransferase family protein  33.02 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1661  acyltransferase family protein  33.02 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.83 
 
 
656 aa  96.3  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1708  acyltransferase family protein  33.02 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  28.05 
 
 
381 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0691  acyltransferase family protein  33.33 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  32.2 
 
 
635 aa  93.6  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  29.66 
 
 
386 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  28.05 
 
 
367 aa  93.2  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.68 
 
 
616 aa  92.8  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  27.27 
 
 
629 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  28.49 
 
 
667 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  35.19 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  28.07 
 
 
351 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  28.65 
 
 
695 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  27.88 
 
 
645 aa  89.7  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  27.25 
 
 
360 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  28.22 
 
 
690 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  26.38 
 
 
665 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  27.46 
 
 
634 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  30.39 
 
 
632 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  33.62 
 
 
376 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  37.89 
 
 
684 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  27.92 
 
 
647 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  28.61 
 
 
695 aa  85.1  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  27.66 
 
 
629 aa  85.1  2e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  26.75 
 
 
603 aa  84.7  3e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  27.11 
 
 
660 aa  84.3  3e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  28.02 
 
 
690 aa  84  4e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  28.15 
 
 
358 aa  82  1e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  24.37 
 
 
660 aa  81.6  2e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  25.31 
 
 
604 aa  81.3  3e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  25.31 
 
 
604 aa  81.3  3e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  27.17 
 
 
660 aa  79.7  8e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  26.95 
 
 
662 aa  79.7  8e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  28.87 
 
 
645 aa  79.3  9e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  29.08 
 
 
372 aa  79  1e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  29.07 
 
 
671 aa  79  2e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  27.09 
 
 
683 aa  78.6  2e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  26.21 
 
 
384 aa  78.6  2e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  27.93 
 
 
695 aa  77.8  3e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  32.17 
 
 
642 aa  77.8  3e-13  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  30.72 
 
 
675 aa  77.8  3e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  26.8 
 
 
360 aa  78.2  3e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  36.87 
 
 
679 aa  77.8  3e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3532  acyltransferase 3  25.53 
 
 
410 aa  77.8  3e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346868  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  32.46 
 
 
632 aa  78.2  3e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  26.2 
 
 
583 aa  77.4  4e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  34.62 
 
 
759 aa  77  5e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  30.67 
 
 
638 aa  77  5e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  25.63 
 
 
603 aa  77.4  5e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  35.96 
 
 
675 aa  77  5e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  25.63 
 
 
603 aa  77.4  5e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  26.63 
 
 
643 aa  77  6e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  30.08 
 
 
658 aa  77  6e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  26.91 
 
 
673 aa  76.6  6e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  33.48 
 
 
377 aa  76.6  7e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  29.43 
 
 
644 aa  76.6  7e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  33.94 
 
 
621 aa  76.3  8e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  28.66 
 
 
358 aa  76.6  8e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  26.1 
 
 
356 aa  75.9  1e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  31.71 
 
 
393 aa  75.5  1e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  26.32 
 
 
651 aa  75.5  2e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  31.64 
 
 
654 aa  75.1  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  32.77 
 
 
662 aa  75.5  2e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.88 
 
 
660 aa  75.1  2e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  27.09 
 
 
665 aa  75.1  2e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  27.59 
 
 
641 aa  75.1  2e-12  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  27.66 
 
 
339 aa  75.5  2e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  34.08 
 
 
584 aa  74.7  3e-12  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  30.36 
 
 
630 aa  74.7  3e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  27.42 
 
 
365 aa  73.9  5e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  25.26 
 
 
696 aa  73.6  6e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  28.28 
 
 
369 aa  73.6  6e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  26.6 
 
 
695 aa  73.2  7e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>