28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2476 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  247  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  49.04 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  48.15 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  35.54 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  37.04 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  38.84 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  33.61 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  32.52 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  32.5 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  35.35 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  31.9 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  36.79 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  31.58 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  37.63 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  30.97 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  32.43 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  34.17 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  30.3 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  28.46 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  25.62 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  37.97 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  29.11 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  35.44 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00390  conserved hypothetical protein  28.69 
 
 		 287 aa  40.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  32.91 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>