More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2470 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  53.21 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  53.48 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  53.48 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 352 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  44.9 
 
 		 298 aa  265  8e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  49.3 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  49.3 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  49.29 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 340 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  45.19 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 327 aa  252  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  47.51 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  47.51 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  47.51 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  47.51 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  47.18 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  47.47 
 
 		 310 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  48.31 
 
 		 321 aa  248  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  42.59 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  46.96 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  48.59 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  48.8 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  48.94 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  48.94 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  48.94 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  40.39 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  48.94 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  48.59 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  48.59 
 
 		 313 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  48.59 
 
 		 313 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  40.39 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  40.07 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  40.39 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.05 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  43.05 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  44.07 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  40.07 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  41.52 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.39 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.39 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  41.2 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  41.2 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  40.07 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  43.69 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  43.41 
 
 		 339 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  39.73 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.61 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  40.2 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  43.38 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  40.21 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  40.65 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  40.26 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  41.16 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  40.6 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  39.43 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  39.38 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  40.22 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  40.22 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  39.93 
 
 		 317 aa  191  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  43.3 
 
 		 299 aa  192  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  37.79 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  37.79 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  36.13 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  40.69 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  39 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  39.65 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  43.86 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  38.06 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  41.23 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  36.64 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  42.32 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  38.13 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>