150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2453 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  100 
 
 		 425 aa  850    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  41.65 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  41.18 
 
 		 415 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  38.05 
 
 		 422 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  40.49 
 
 		 419 aa  222  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  38.52 
 
 		 422 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  39.47 
 
 		 420 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  38.12 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  37.86 
 
 		 456 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  39.67 
 
 		 422 aa  203  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  37.6 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  35.52 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  35.43 
 
 		 476 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  35.79 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  37.75 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  39.16 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  35.7 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  36.16 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  38.31 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  37.56 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  34.26 
 
 		 480 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  36.16 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  36.59 
 
 		 429 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  30.65 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  28.24 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  35.86 
 
 		 504 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  37.59 
 
 		 476 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  36.02 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  33.9 
 
 		 442 aa  149  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  35.92 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  34.09 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  33.17 
 
 		 442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  36.73 
 
 		 439 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  31.44 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  32.46 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  31.35 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  30.15 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  32.81 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  30.43 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  33.08 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  28.13 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.76 
 
 		 481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  32.57 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  24.73 
 
 		 495 aa  117  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.43 
 
 		 445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  25.28 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  27.79 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  32.23 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  27.23 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  27.56 
 
 		 463 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  27.23 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  25.16 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  24.31 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  28.8 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.65 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  28.17 
 
 		 1199 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  24.04 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  27.6 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  23.77 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  29.61 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  28.57 
 
 		 628 aa  63.2  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  29.76 
 
 		 1274 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  29.5 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  25.78 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  28.16 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  45.45 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.08 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  28.93 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.41 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.72 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  25.32 
 
 		 492 aa  57  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  25.67 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.27 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  29.84 
 
 		 999 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.84 
 
 		 619 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  43.48 
 
 		 510 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  25.27 
 
 		 616 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.62 
 
 		 619 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.99 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.06 
 
 		 624 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  28.02 
 
 		 487 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  45.83 
 
 		 447 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  47.54 
 
 		 492 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  25.63 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  38.89 
 
 		 350 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  39.73 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.4 
 
 		 565 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  43.66 
 
 		 657 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  50 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  42.67 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  41.03 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  39.33 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  45.83 
 
 		 450 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  45.83 
 
 		 450 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  41.1 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  43.42 
 
 		 470 aa  50.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  28.01 
 
 		 465 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  25.53 
 
 		 600 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>