More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2445 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  67.54 
 
 		 469 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  82.39 
 
 		 463 aa  799    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  100 
 
 		 466 aa  966    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  68.48 
 
 		 472 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  72.61 
 
 		 463 aa  698    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  68.03 
 
 		 469 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  67.17 
 
 		 463 aa  645    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  85.62 
 
 		 482 aa  829    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  67.81 
 
 		 469 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  68.14 
 
 		 475 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  70 
 
 		 464 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  68.26 
 
 		 472 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  87.58 
 
 		 462 aa  840    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  68.32 
 
 		 469 aa  654    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  70.22 
 
 		 464 aa  665    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  72.61 
 
 		 478 aa  698    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  83.26 
 
 		 463 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  69.78 
 
 		 464 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  84.31 
 
 		 463 aa  815    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  69.06 
 
 		 474 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  69.06 
 
 		 472 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  71.3 
 
 		 462 aa  673    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  68.94 
 
 		 465 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  68.19 
 
 		 471 aa  634    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  68.04 
 
 		 465 aa  660    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  71.74 
 
 		 463 aa  671    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  71.02 
 
 		 464 aa  651    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  82.39 
 
 		 463 aa  775    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  72.17 
 
 		 463 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  71.27 
 
 		 465 aa  683    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  67.32 
 
 		 492 aa  641    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  67.32 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  63.54 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  68.91 
 
 		 472 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  64.1 
 
 		 544 aa  618  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  68.1 
 
 		 472 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  63.91 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  64.21 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  64.5 
 
 		 510 aa  607  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  62.69 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  62.55 
 
 		 465 aa  596  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  62.88 
 
 		 464 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  63.1 
 
 		 474 aa  595  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  62.66 
 
 		 464 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 463 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  61.93 
 
 		 464 aa  591  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  61.93 
 
 		 471 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  63.24 
 
 		 461 aa  591  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 461 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 461 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  62.91 
 
 		 464 aa  591  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  62.47 
 
 		 463 aa  588  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  61.54 
 
 		 458 aa  586  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 461 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  62.8 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  62.72 
 
 		 631 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  61.93 
 
 		 463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 459 aa  581  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 459 aa  579  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  61.52 
 
 		 466 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  60.7 
 
 		 461 aa  578  1e-164  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 464 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  62.14 
 
 		 464 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  60.04 
 
 		 461 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  61.74 
 
 		 463 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  62.47 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  59.44 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  61.74 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  59.74 
 
 		 468 aa  568  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 466 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  62.61 
 
 		 466 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  62.8 
 
 		 464 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  59.01 
 
 		 465 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 466 aa  561  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  58.82 
 
 		 467 aa  555  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  58.91 
 
 		 467 aa  557  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  59.47 
 
 		 462 aa  557  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  59.22 
 
 		 465 aa  555  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 462 aa  551  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 462 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  58.11 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 467 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 467 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  58.39 
 
 		 463 aa  552  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  58.39 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 467 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  57.95 
 
 		 462 aa  554  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 467 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>